Protein–RNA interactions for Protein: P51168

SCNN1B, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1BP51168 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SCNN1BP51168 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SCNN1BP51168 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCNN1BP51168 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCNN1BP51168 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCNN1BP51168 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCNN1BP51168 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCNN1BP51168 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCNN1BP51168 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCNN1BP51168 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCNN1BP51168 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCNN1BP51168 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCNN1BP51168 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCNN1BP51168 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCNN1BP51168 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCNN1BP51168 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCNN1BP51168 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCNN1BP51168 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SCNN1BP51168 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SCNN1BP51168 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SCNN1BP51168 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SCNN1BP51168 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SCNN1BP51168 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SCNN1BP51168 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SCNN1BP51168 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SCNN1BP51168 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SCNN1BP51168 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SCNN1BP51168 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCNN1BP51168 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCNN1BP51168 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCNN1BP51168 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCNN1BP51168 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCNN1BP51168 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCNN1BP51168 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCNN1BP51168 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SCNN1BP51168 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SCNN1BP51168 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SCNN1BP51168 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SCNN1BP51168 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCNN1BP51168 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCNN1BP51168 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCNN1BP51168 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCNN1BP51168 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCNN1BP51168 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCNN1BP51168 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCNN1BP51168 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCNN1BP51168 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCNN1BP51168 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCNN1BP51168 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCNN1BP51168 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCNN1BP51168 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCNN1BP51168 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCNN1BP51168 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCNN1BP51168 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCNN1BP51168 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCNN1BP51168 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCNN1BP51168 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCNN1BP51168 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCNN1BP51168 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCNN1BP51168 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCNN1BP51168 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCNN1BP51168 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCNN1BP51168 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCNN1BP51168 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCNN1BP51168 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCNN1BP51168 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCNN1BP51168 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCNN1BP51168 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCNN1BP51168 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCNN1BP51168 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCNN1BP51168 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCNN1BP51168 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCNN1BP51168 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCNN1BP51168 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SCNN1BP51168 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCNN1BP51168 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCNN1BP51168 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCNN1BP51168 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCNN1BP51168 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCNN1BP51168 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCNN1BP51168 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCNN1BP51168 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCNN1BP51168 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCNN1BP51168 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCNN1BP51168 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCNN1BP51168 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCNN1BP51168 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCNN1BP51168 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCNN1BP51168 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCNN1BP51168 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCNN1BP51168 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCNN1BP51168 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCNN1BP51168 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SCNN1BP51168 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCNN1BP51168 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCNN1BP51168 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SCNN1BP51168 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SCNN1BP51168 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SCNN1BP51168 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SCNN1BP51168 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms