Protein–RNA interactions for Protein: P49757

NUMB, Protein numb homolog, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUMBP49757 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NUMBP49757 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NUMBP49757 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NUMBP49757 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NUMBP49757 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NUMBP49757 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NUMBP49757 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NUMBP49757 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NUMBP49757 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUMBP49757 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NUMBP49757 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NUMBP49757 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NUMBP49757 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NUMBP49757 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NUMBP49757 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUMBP49757 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUMBP49757 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUMBP49757 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NUMBP49757 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NUMBP49757 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NUMBP49757 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NUMBP49757 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NUMBP49757 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NUMBP49757 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
NUMBP49757 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NUMBP49757 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NUMBP49757 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NUMBP49757 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NUMBP49757 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NUMBP49757 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
NUMBP49757 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NUMBP49757 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NUMBP49757 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NUMBP49757 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NUMBP49757 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NUMBP49757 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NUMBP49757 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NUMBP49757 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NUMBP49757 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
NUMBP49757 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NUMBP49757 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NUMBP49757 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NUMBP49757 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NUMBP49757 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NUMBP49757 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NUMBP49757 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NUMBP49757 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NUMBP49757 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NUMBP49757 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NUMBP49757 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NUMBP49757 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NUMBP49757 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NUMBP49757 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NUMBP49757 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
NUMBP49757 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NUMBP49757 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NUMBP49757 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NUMBP49757 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUMBP49757 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUMBP49757 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUMBP49757 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
NUMBP49757 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NUMBP49757 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
NUMBP49757 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUMBP49757 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUMBP49757 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUMBP49757 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NUMBP49757 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NUMBP49757 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUMBP49757 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUMBP49757 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUMBP49757 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUMBP49757 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUMBP49757 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUMBP49757 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUMBP49757 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUMBP49757 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUMBP49757 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NUMBP49757 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUMBP49757 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUMBP49757 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NUMBP49757 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NUMBP49757 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NUMBP49757 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NUMBP49757 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NUMBP49757 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
NUMBP49757 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NUMBP49757 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NUMBP49757 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NUMBP49757 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NUMBP49757 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NUMBP49757 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NUMBP49757 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NUMBP49757 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NUMBP49757 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NUMBP49757 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NUMBP49757 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NUMBP49757 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NUMBP49757 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.54■■■□□ 2
NUMBP49757 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms