Protein–RNA interactions for Protein: P49643

PRIM2, DNA primase large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM2P49643 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRIM2P49643 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRIM2P49643 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRIM2P49643 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRIM2P49643 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRIM2P49643 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRIM2P49643 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRIM2P49643 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRIM2P49643 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRIM2P49643 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRIM2P49643 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRIM2P49643 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRIM2P49643 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRIM2P49643 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRIM2P49643 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRIM2P49643 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRIM2P49643 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRIM2P49643 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRIM2P49643 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRIM2P49643 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRIM2P49643 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRIM2P49643 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRIM2P49643 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRIM2P49643 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRIM2P49643 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRIM2P49643 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRIM2P49643 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRIM2P49643 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRIM2P49643 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRIM2P49643 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRIM2P49643 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRIM2P49643 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRIM2P49643 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRIM2P49643 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRIM2P49643 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PRIM2P49643 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRIM2P49643 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRIM2P49643 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRIM2P49643 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRIM2P49643 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRIM2P49643 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRIM2P49643 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRIM2P49643 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRIM2P49643 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRIM2P49643 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRIM2P49643 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRIM2P49643 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRIM2P49643 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRIM2P49643 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRIM2P49643 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRIM2P49643 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRIM2P49643 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRIM2P49643 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
PRIM2P49643 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRIM2P49643 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRIM2P49643 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRIM2P49643 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRIM2P49643 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRIM2P49643 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRIM2P49643 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRIM2P49643 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRIM2P49643 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRIM2P49643 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRIM2P49643 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRIM2P49643 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRIM2P49643 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRIM2P49643 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRIM2P49643 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRIM2P49643 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRIM2P49643 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRIM2P49643 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRIM2P49643 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRIM2P49643 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRIM2P49643 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRIM2P49643 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRIM2P49643 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRIM2P49643 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRIM2P49643 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRIM2P49643 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRIM2P49643 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PRIM2P49643 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRIM2P49643 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRIM2P49643 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRIM2P49643 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRIM2P49643 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PRIM2P49643 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PRIM2P49643 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRIM2P49643 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRIM2P49643 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRIM2P49643 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRIM2P49643 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRIM2P49643 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRIM2P49643 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRIM2P49643 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRIM2P49643 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRIM2P49643 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRIM2P49643 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRIM2P49643 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRIM2P49643 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRIM2P49643 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms