Protein–RNA interactions for Protein: P49590

HARS2, Probable histidine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HARS2P49590 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HARS2P49590 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HARS2P49590 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HARS2P49590 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HARS2P49590 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
HARS2P49590 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HARS2P49590 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HARS2P49590 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HARS2P49590 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HARS2P49590 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HARS2P49590 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HARS2P49590 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HARS2P49590 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HARS2P49590 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HARS2P49590 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HARS2P49590 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HARS2P49590 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HARS2P49590 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HARS2P49590 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HARS2P49590 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HARS2P49590 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HARS2P49590 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HARS2P49590 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HARS2P49590 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HARS2P49590 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HARS2P49590 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HARS2P49590 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
HARS2P49590 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HARS2P49590 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HARS2P49590 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HARS2P49590 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
HARS2P49590 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
HARS2P49590 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HARS2P49590 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HARS2P49590 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HARS2P49590 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HARS2P49590 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HARS2P49590 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HARS2P49590 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
HARS2P49590 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HARS2P49590 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HARS2P49590 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HARS2P49590 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HARS2P49590 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HARS2P49590 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
HARS2P49590 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HARS2P49590 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HARS2P49590 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HARS2P49590 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HARS2P49590 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HARS2P49590 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HARS2P49590 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HARS2P49590 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
HARS2P49590 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.08
HARS2P49590 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HARS2P49590 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HARS2P49590 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
HARS2P49590 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HARS2P49590 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HARS2P49590 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
HARS2P49590 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28■■■□□ 2.07
HARS2P49590 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HARS2P49590 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HARS2P49590 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HARS2P49590 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HARS2P49590 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HARS2P49590 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HARS2P49590 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HARS2P49590 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HARS2P49590 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
HARS2P49590 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
HARS2P49590 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HARS2P49590 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HARS2P49590 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HARS2P49590 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HARS2P49590 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HARS2P49590 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HARS2P49590 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HARS2P49590 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HARS2P49590 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HARS2P49590 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HARS2P49590 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
HARS2P49590 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HARS2P49590 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HARS2P49590 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HARS2P49590 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HARS2P49590 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HARS2P49590 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HARS2P49590 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HARS2P49590 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HARS2P49590 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HARS2P49590 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HARS2P49590 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HARS2P49590 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HARS2P49590 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HARS2P49590 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HARS2P49590 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HARS2P49590 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HARS2P49590 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HARS2P49590 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.5 ms