Protein–RNA interactions for Protein: P49418

AMPH, Amphiphysin, humanhuman

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPHP49418 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC36.84■■■■□ 3.49
AMPHP49418 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
AMPHP49418 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
AMPHP49418 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
AMPHP49418 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
AMPHP49418 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
AMPHP49418 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
AMPHP49418 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
AMPHP49418 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
AMPHP49418 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
AMPHP49418 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
AMPHP49418 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
AMPHP49418 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
AMPHP49418 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
AMPHP49418 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
AMPHP49418 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
AMPHP49418 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
AMPHP49418 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
AMPHP49418 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
AMPHP49418 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
AMPHP49418 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
AMPHP49418 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
AMPHP49418 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
AMPHP49418 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
AMPHP49418 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
AMPHP49418 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
AMPHP49418 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
AMPHP49418 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.61■■■■□ 3.45
AMPHP49418 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
AMPHP49418 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
AMPHP49418 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
AMPHP49418 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
AMPHP49418 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
AMPHP49418 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
AMPHP49418 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
AMPHP49418 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
AMPHP49418 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
AMPHP49418 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC36.57■■■■□ 3.44
AMPHP49418 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC36.57■■■■□ 3.44
AMPHP49418 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
AMPHP49418 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
AMPHP49418 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
AMPHP49418 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
AMPHP49418 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
AMPHP49418 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
AMPHP49418 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
AMPHP49418 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
AMPHP49418 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
AMPHP49418 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
AMPHP49418 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
AMPHP49418 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC36.52■■■■□ 3.44
AMPHP49418 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC36.52■■■■□ 3.44
AMPHP49418 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
AMPHP49418 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
AMPHP49418 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
AMPHP49418 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
AMPHP49418 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
AMPHP49418 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
AMPHP49418 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
AMPHP49418 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
AMPHP49418 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
AMPHP49418 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
AMPHP49418 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
AMPHP49418 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
AMPHP49418 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
AMPHP49418 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
AMPHP49418 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
AMPHP49418 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
AMPHP49418 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
AMPHP49418 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC36.41■■■■□ 3.42
AMPHP49418 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
AMPHP49418 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
AMPHP49418 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
AMPHP49418 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
AMPHP49418 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
AMPHP49418 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
AMPHP49418 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
AMPHP49418 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
AMPHP49418 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
AMPHP49418 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
AMPHP49418 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
AMPHP49418 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
AMPHP49418 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
AMPHP49418 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
AMPHP49418 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
AMPHP49418 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
AMPHP49418 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
AMPHP49418 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
AMPHP49418 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
AMPHP49418 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
AMPHP49418 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
AMPHP49418 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
AMPHP49418 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
AMPHP49418 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
AMPHP49418 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
AMPHP49418 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC36.28■■■■□ 3.4
AMPHP49418 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
AMPHP49418 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
AMPHP49418 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC36.25■■■■□ 3.39
AMPHP49418 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms