Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
GRIA4P48058 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
GRIA4P48058 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GRIA4P48058 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GRIA4P48058 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GRIA4P48058 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GRIA4P48058 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GRIA4P48058 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
GRIA4P48058 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GRIA4P48058 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GRIA4P48058 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GRIA4P48058 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
GRIA4P48058 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GRIA4P48058 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GRIA4P48058 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GRIA4P48058 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GRIA4P48058 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GRIA4P48058 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GRIA4P48058 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GRIA4P48058 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GRIA4P48058 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GRIA4P48058 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GRIA4P48058 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GRIA4P48058 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GRIA4P48058 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
GRIA4P48058 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GRIA4P48058 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
GRIA4P48058 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GRIA4P48058 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GRIA4P48058 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GRIA4P48058 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GRIA4P48058 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GRIA4P48058 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GRIA4P48058 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GRIA4P48058 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GRIA4P48058 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GRIA4P48058 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GRIA4P48058 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GRIA4P48058 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GRIA4P48058 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GRIA4P48058 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GRIA4P48058 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GRIA4P48058 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
GRIA4P48058 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GRIA4P48058 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GRIA4P48058 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GRIA4P48058 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GRIA4P48058 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GRIA4P48058 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GRIA4P48058 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.55■■■□□ 2
GRIA4P48058 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GRIA4P48058 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GRIA4P48058 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GRIA4P48058 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GRIA4P48058 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
GRIA4P48058 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
GRIA4P48058 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GRIA4P48058 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GRIA4P48058 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GRIA4P48058 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GRIA4P48058 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GRIA4P48058 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GRIA4P48058 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GRIA4P48058 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
GRIA4P48058 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GRIA4P48058 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GRIA4P48058 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GRIA4P48058 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GRIA4P48058 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GRIA4P48058 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GRIA4P48058 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GRIA4P48058 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GRIA4P48058 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GRIA4P48058 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GRIA4P48058 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GRIA4P48058 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GRIA4P48058 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GRIA4P48058 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GRIA4P48058 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GRIA4P48058 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GRIA4P48058 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GRIA4P48058 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GRIA4P48058 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
GRIA4P48058 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GRIA4P48058 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GRIA4P48058 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GRIA4P48058 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GRIA4P48058 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GRIA4P48058 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
GRIA4P48058 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GRIA4P48058 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GRIA4P48058 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
GRIA4P48058 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
GRIA4P48058 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
GRIA4P48058 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GRIA4P48058 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GRIA4P48058 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GRIA4P48058 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GRIA4P48058 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GRIA4P48058 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms