Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
XCR1P46094 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
XCR1P46094 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
XCR1P46094 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
XCR1P46094 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
XCR1P46094 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
XCR1P46094 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
XCR1P46094 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
XCR1P46094 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
XCR1P46094 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
XCR1P46094 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
XCR1P46094 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
XCR1P46094 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
XCR1P46094 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
XCR1P46094 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
XCR1P46094 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
XCR1P46094 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
XCR1P46094 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
XCR1P46094 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
XCR1P46094 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
XCR1P46094 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
XCR1P46094 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
XCR1P46094 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
XCR1P46094 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
XCR1P46094 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
XCR1P46094 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
XCR1P46094 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
XCR1P46094 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
XCR1P46094 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
XCR1P46094 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
XCR1P46094 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
XCR1P46094 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
XCR1P46094 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
XCR1P46094 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
XCR1P46094 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
XCR1P46094 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
XCR1P46094 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
XCR1P46094 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
XCR1P46094 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
XCR1P46094 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
XCR1P46094 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
XCR1P46094 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
XCR1P46094 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
XCR1P46094 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
XCR1P46094 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
XCR1P46094 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
XCR1P46094 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
XCR1P46094 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
XCR1P46094 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
XCR1P46094 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
XCR1P46094 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
XCR1P46094 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
XCR1P46094 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
XCR1P46094 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
XCR1P46094 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
XCR1P46094 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
XCR1P46094 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
XCR1P46094 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
XCR1P46094 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
XCR1P46094 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
XCR1P46094 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
XCR1P46094 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
XCR1P46094 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
XCR1P46094 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
XCR1P46094 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
XCR1P46094 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
XCR1P46094 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
XCR1P46094 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
XCR1P46094 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
XCR1P46094 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
XCR1P46094 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
XCR1P46094 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
XCR1P46094 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
XCR1P46094 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
XCR1P46094 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
XCR1P46094 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
XCR1P46094 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
XCR1P46094 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
XCR1P46094 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
XCR1P46094 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
XCR1P46094 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
XCR1P46094 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
XCR1P46094 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
XCR1P46094 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
XCR1P46094 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
XCR1P46094 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
XCR1P46094 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
XCR1P46094 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
XCR1P46094 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
XCR1P46094 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
XCR1P46094 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
XCR1P46094 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
XCR1P46094 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
XCR1P46094 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
XCR1P46094 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
XCR1P46094 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
XCR1P46094 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
XCR1P46094 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
XCR1P46094 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
XCR1P46094 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms