Protein–RNA interactions for Protein: P45844

ABCG1, ATP-binding cassette sub-family G member 1, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCG1P45844 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCG1P45844 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCG1P45844 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCG1P45844 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCG1P45844 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCG1P45844 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCG1P45844 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCG1P45844 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCG1P45844 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ABCG1P45844 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ABCG1P45844 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ABCG1P45844 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ABCG1P45844 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ABCG1P45844 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ABCG1P45844 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ABCG1P45844 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCG1P45844 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ABCG1P45844 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ABCG1P45844 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ABCG1P45844 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ABCG1P45844 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ABCG1P45844 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCG1P45844 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCG1P45844 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCG1P45844 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ABCG1P45844 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ABCG1P45844 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ABCG1P45844 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ABCG1P45844 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ABCG1P45844 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ABCG1P45844 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ABCG1P45844 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ABCG1P45844 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ABCG1P45844 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ABCG1P45844 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ABCG1P45844 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ABCG1P45844 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ABCG1P45844 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ABCG1P45844 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ABCG1P45844 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ABCG1P45844 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ABCG1P45844 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ABCG1P45844 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ABCG1P45844 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ABCG1P45844 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ABCG1P45844 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ABCG1P45844 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ABCG1P45844 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ABCG1P45844 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ABCG1P45844 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ABCG1P45844 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCG1P45844 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCG1P45844 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCG1P45844 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCG1P45844 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCG1P45844 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCG1P45844 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCG1P45844 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCG1P45844 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCG1P45844 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ABCG1P45844 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ABCG1P45844 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ABCG1P45844 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ABCG1P45844 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ABCG1P45844 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ABCG1P45844 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ABCG1P45844 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ABCG1P45844 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ABCG1P45844 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ABCG1P45844 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ABCG1P45844 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ABCG1P45844 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ABCG1P45844 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ABCG1P45844 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ABCG1P45844 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCG1P45844 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCG1P45844 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCG1P45844 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCG1P45844 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCG1P45844 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ABCG1P45844 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCG1P45844 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCG1P45844 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
ABCG1P45844 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ABCG1P45844 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ABCG1P45844 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ABCG1P45844 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ABCG1P45844 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ABCG1P45844 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ABCG1P45844 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ABCG1P45844 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ABCG1P45844 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ABCG1P45844 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ABCG1P45844 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ABCG1P45844 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
ABCG1P45844 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ABCG1P45844 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ABCG1P45844 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ABCG1P45844 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ABCG1P45844 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms