Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PTGER3P43115 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTGER3P43115 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTGER3P43115 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PTGER3P43115 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTGER3P43115 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTGER3P43115 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTGER3P43115 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTGER3P43115 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTGER3P43115 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTGER3P43115 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTGER3P43115 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTGER3P43115 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTGER3P43115 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PTGER3P43115 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTGER3P43115 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTGER3P43115 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTGER3P43115 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTGER3P43115 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTGER3P43115 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PTGER3P43115 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTGER3P43115 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTGER3P43115 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTGER3P43115 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTGER3P43115 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTGER3P43115 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTGER3P43115 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PTGER3P43115 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTGER3P43115 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTGER3P43115 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PTGER3P43115 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PTGER3P43115 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PTGER3P43115 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PTGER3P43115 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PTGER3P43115 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTGER3P43115 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PTGER3P43115 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PTGER3P43115 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PTGER3P43115 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTGER3P43115 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTGER3P43115 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PTGER3P43115 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PTGER3P43115 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
PTGER3P43115 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTGER3P43115 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTGER3P43115 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTGER3P43115 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTGER3P43115 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTGER3P43115 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTGER3P43115 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTGER3P43115 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTGER3P43115 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTGER3P43115 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTGER3P43115 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTGER3P43115 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTGER3P43115 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTGER3P43115 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTGER3P43115 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PTGER3P43115 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTGER3P43115 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTGER3P43115 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTGER3P43115 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTGER3P43115 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTGER3P43115 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTGER3P43115 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTGER3P43115 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTGER3P43115 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTGER3P43115 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTGER3P43115 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTGER3P43115 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTGER3P43115 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTGER3P43115 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTGER3P43115 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTGER3P43115 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PTGER3P43115 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTGER3P43115 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTGER3P43115 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTGER3P43115 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTGER3P43115 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTGER3P43115 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTGER3P43115 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PTGER3P43115 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTGER3P43115 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTGER3P43115 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTGER3P43115 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTGER3P43115 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTGER3P43115 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTGER3P43115 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTGER3P43115 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PTGER3P43115 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTGER3P43115 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTGER3P43115 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTGER3P43115 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTGER3P43115 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTGER3P43115 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTGER3P43115 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTGER3P43115 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTGER3P43115 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTGER3P43115 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTGER3P43115 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms