Protein–RNA interactions for Protein: P41440

SLC19A1, Folate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC19A1P41440 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC19A1P41440 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC19A1P41440 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC19A1P41440 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC19A1P41440 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC19A1P41440 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC19A1P41440 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC19A1P41440 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC19A1P41440 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC19A1P41440 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC19A1P41440 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC19A1P41440 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC19A1P41440 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC19A1P41440 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC19A1P41440 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC19A1P41440 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC19A1P41440 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC19A1P41440 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC19A1P41440 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC19A1P41440 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC19A1P41440 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC19A1P41440 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC19A1P41440 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC19A1P41440 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC19A1P41440 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC19A1P41440 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC19A1P41440 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC19A1P41440 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC19A1P41440 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC19A1P41440 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC19A1P41440 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC19A1P41440 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC19A1P41440 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC19A1P41440 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC19A1P41440 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC19A1P41440 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC19A1P41440 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC19A1P41440 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC19A1P41440 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC19A1P41440 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC19A1P41440 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC19A1P41440 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC19A1P41440 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SLC19A1P41440 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC19A1P41440 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC19A1P41440 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC19A1P41440 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC19A1P41440 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC19A1P41440 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC19A1P41440 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC19A1P41440 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC19A1P41440 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC19A1P41440 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC19A1P41440 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC19A1P41440 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC19A1P41440 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC19A1P41440 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC19A1P41440 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC19A1P41440 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC19A1P41440 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC19A1P41440 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC19A1P41440 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC19A1P41440 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC19A1P41440 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC19A1P41440 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC19A1P41440 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC19A1P41440 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC19A1P41440 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC19A1P41440 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC19A1P41440 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC19A1P41440 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC19A1P41440 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC19A1P41440 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC19A1P41440 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC19A1P41440 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC19A1P41440 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC19A1P41440 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC19A1P41440 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC19A1P41440 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC19A1P41440 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC19A1P41440 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC19A1P41440 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
SLC19A1P41440 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SLC19A1P41440 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC19A1P41440 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC19A1P41440 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC19A1P41440 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC19A1P41440 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC19A1P41440 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC19A1P41440 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC19A1P41440 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC19A1P41440 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC19A1P41440 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC19A1P41440 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC19A1P41440 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC19A1P41440 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC19A1P41440 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC19A1P41440 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC19A1P41440 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC19A1P41440 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms