Protein–RNA interactions for Protein: P41002

CCNF, Cyclin-F, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNFP41002 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCNFP41002 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCNFP41002 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCNFP41002 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCNFP41002 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCNFP41002 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCNFP41002 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCNFP41002 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCNFP41002 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCNFP41002 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCNFP41002 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCNFP41002 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCNFP41002 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCNFP41002 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCNFP41002 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCNFP41002 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCNFP41002 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCNFP41002 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CCNFP41002 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCNFP41002 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCNFP41002 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCNFP41002 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCNFP41002 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCNFP41002 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCNFP41002 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCNFP41002 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCNFP41002 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCNFP41002 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCNFP41002 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCNFP41002 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCNFP41002 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCNFP41002 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCNFP41002 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCNFP41002 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCNFP41002 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCNFP41002 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCNFP41002 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCNFP41002 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCNFP41002 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCNFP41002 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCNFP41002 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCNFP41002 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCNFP41002 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCNFP41002 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCNFP41002 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCNFP41002 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCNFP41002 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCNFP41002 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCNFP41002 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCNFP41002 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCNFP41002 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCNFP41002 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCNFP41002 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCNFP41002 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCNFP41002 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCNFP41002 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCNFP41002 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCNFP41002 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCNFP41002 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCNFP41002 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCNFP41002 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCNFP41002 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCNFP41002 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCNFP41002 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCNFP41002 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCNFP41002 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCNFP41002 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCNFP41002 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCNFP41002 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCNFP41002 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCNFP41002 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCNFP41002 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCNFP41002 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCNFP41002 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCNFP41002 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCNFP41002 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCNFP41002 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCNFP41002 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCNFP41002 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCNFP41002 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCNFP41002 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CCNFP41002 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CCNFP41002 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCNFP41002 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCNFP41002 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCNFP41002 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCNFP41002 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCNFP41002 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCNFP41002 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCNFP41002 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCNFP41002 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCNFP41002 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCNFP41002 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCNFP41002 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CCNFP41002 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CCNFP41002 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCNFP41002 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCNFP41002 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCNFP41002 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCNFP41002 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms