Protein–RNA interactions for Protein: P41002

CCNF, Cyclin-F, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNFP41002 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CCNFP41002 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CCNFP41002 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CCNFP41002 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CCNFP41002 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CCNFP41002 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
CCNFP41002 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CCNFP41002 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CCNFP41002 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CCNFP41002 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CCNFP41002 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CCNFP41002 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CCNFP41002 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
CCNFP41002 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
CCNFP41002 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
CCNFP41002 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.77■■■□□ 2.68
CCNFP41002 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
CCNFP41002 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
CCNFP41002 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CCNFP41002 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CCNFP41002 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CCNFP41002 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CCNFP41002 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CCNFP41002 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CCNFP41002 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CCNFP41002 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.57
CCNFP41002 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CCNFP41002 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CCNFP41002 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCNFP41002 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CCNFP41002 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CCNFP41002 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CCNFP41002 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CCNFP41002 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CCNFP41002 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CCNFP41002 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CCNFP41002 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CCNFP41002 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CCNFP41002 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CCNFP41002 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CCNFP41002 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCNFP41002 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCNFP41002 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCNFP41002 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCNFP41002 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CCNFP41002 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CCNFP41002 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CCNFP41002 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCNFP41002 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCNFP41002 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCNFP41002 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCNFP41002 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCNFP41002 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCNFP41002 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCNFP41002 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCNFP41002 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCNFP41002 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCNFP41002 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCNFP41002 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCNFP41002 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCNFP41002 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCNFP41002 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCNFP41002 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCNFP41002 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCNFP41002 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCNFP41002 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCNFP41002 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCNFP41002 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCNFP41002 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCNFP41002 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCNFP41002 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCNFP41002 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCNFP41002 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCNFP41002 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCNFP41002 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCNFP41002 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCNFP41002 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCNFP41002 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCNFP41002 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCNFP41002 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCNFP41002 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCNFP41002 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCNFP41002 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCNFP41002 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCNFP41002 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCNFP41002 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCNFP41002 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
CCNFP41002 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CCNFP41002 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCNFP41002 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCNFP41002 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCNFP41002 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCNFP41002 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCNFP41002 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCNFP41002 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCNFP41002 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCNFP41002 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCNFP41002 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCNFP41002 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CCNFP41002 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms