Protein–RNA interactions for Protein: P39023

RPL3, 60S ribosomal protein L3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL3P39023 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPL3P39023 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPL3P39023 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPL3P39023 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPL3P39023 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPL3P39023 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPL3P39023 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPL3P39023 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPL3P39023 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPL3P39023 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPL3P39023 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPL3P39023 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPL3P39023 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPL3P39023 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPL3P39023 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPL3P39023 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPL3P39023 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPL3P39023 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPL3P39023 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPL3P39023 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RPL3P39023 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPL3P39023 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPL3P39023 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPL3P39023 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPL3P39023 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPL3P39023 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RPL3P39023 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPL3P39023 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPL3P39023 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPL3P39023 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPL3P39023 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPL3P39023 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPL3P39023 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPL3P39023 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RPL3P39023 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RPL3P39023 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RPL3P39023 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPL3P39023 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPL3P39023 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPL3P39023 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPL3P39023 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RPL3P39023 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RPL3P39023 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPL3P39023 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPL3P39023 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPL3P39023 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPL3P39023 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RPL3P39023 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPL3P39023 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPL3P39023 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RPL3P39023 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPL3P39023 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPL3P39023 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPL3P39023 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPL3P39023 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPL3P39023 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPL3P39023 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPL3P39023 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPL3P39023 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPL3P39023 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPL3P39023 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPL3P39023 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPL3P39023 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPL3P39023 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPL3P39023 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPL3P39023 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPL3P39023 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPL3P39023 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPL3P39023 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPL3P39023 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPL3P39023 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RPL3P39023 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPL3P39023 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPL3P39023 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPL3P39023 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RPL3P39023 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPL3P39023 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPL3P39023 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPL3P39023 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPL3P39023 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPL3P39023 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPL3P39023 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPL3P39023 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPL3P39023 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPL3P39023 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPL3P39023 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPL3P39023 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RPL3P39023 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RPL3P39023 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RPL3P39023 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPL3P39023 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPL3P39023 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPL3P39023 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPL3P39023 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPL3P39023 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPL3P39023 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPL3P39023 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPL3P39023 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPL3P39023 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPL3P39023 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms