Protein–RNA interactions for Protein: P38646

HSPA9, Stress-70 protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA9P38646 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HSPA9P38646 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HSPA9P38646 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HSPA9P38646 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HSPA9P38646 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HSPA9P38646 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HSPA9P38646 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HSPA9P38646 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HSPA9P38646 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HSPA9P38646 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HSPA9P38646 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
HSPA9P38646 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HSPA9P38646 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HSPA9P38646 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HSPA9P38646 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HSPA9P38646 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HSPA9P38646 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HSPA9P38646 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HSPA9P38646 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HSPA9P38646 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HSPA9P38646 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HSPA9P38646 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HSPA9P38646 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HSPA9P38646 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HSPA9P38646 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HSPA9P38646 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HSPA9P38646 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HSPA9P38646 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HSPA9P38646 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HSPA9P38646 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HSPA9P38646 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HSPA9P38646 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HSPA9P38646 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HSPA9P38646 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HSPA9P38646 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HSPA9P38646 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HSPA9P38646 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HSPA9P38646 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HSPA9P38646 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HSPA9P38646 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HSPA9P38646 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HSPA9P38646 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HSPA9P38646 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HSPA9P38646 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HSPA9P38646 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
HSPA9P38646 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HSPA9P38646 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HSPA9P38646 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HSPA9P38646 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HSPA9P38646 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HSPA9P38646 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HSPA9P38646 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HSPA9P38646 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HSPA9P38646 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HSPA9P38646 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HSPA9P38646 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HSPA9P38646 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HSPA9P38646 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HSPA9P38646 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HSPA9P38646 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
HSPA9P38646 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HSPA9P38646 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HSPA9P38646 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HSPA9P38646 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HSPA9P38646 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HSPA9P38646 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HSPA9P38646 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
HSPA9P38646 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HSPA9P38646 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HSPA9P38646 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HSPA9P38646 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HSPA9P38646 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HSPA9P38646 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
HSPA9P38646 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HSPA9P38646 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HSPA9P38646 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HSPA9P38646 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HSPA9P38646 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HSPA9P38646 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HSPA9P38646 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HSPA9P38646 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HSPA9P38646 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HSPA9P38646 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HSPA9P38646 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HSPA9P38646 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
HSPA9P38646 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HSPA9P38646 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HSPA9P38646 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HSPA9P38646 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HSPA9P38646 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
HSPA9P38646 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HSPA9P38646 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HSPA9P38646 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HSPA9P38646 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HSPA9P38646 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HSPA9P38646 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HSPA9P38646 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HSPA9P38646 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HSPA9P38646 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HSPA9P38646 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms