Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CTNNA1P35221 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CTNNA1P35221 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CTNNA1P35221 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CTNNA1P35221 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CTNNA1P35221 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CTNNA1P35221 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CTNNA1P35221 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CTNNA1P35221 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CTNNA1P35221 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CTNNA1P35221 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CTNNA1P35221 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CTNNA1P35221 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CTNNA1P35221 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CTNNA1P35221 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CTNNA1P35221 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CTNNA1P35221 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CTNNA1P35221 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CTNNA1P35221 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CTNNA1P35221 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CTNNA1P35221 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CTNNA1P35221 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CTNNA1P35221 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CTNNA1P35221 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CTNNA1P35221 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CTNNA1P35221 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CTNNA1P35221 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CTNNA1P35221 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CTNNA1P35221 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CTNNA1P35221 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CTNNA1P35221 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CTNNA1P35221 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CTNNA1P35221 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CTNNA1P35221 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CTNNA1P35221 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CTNNA1P35221 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CTNNA1P35221 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CTNNA1P35221 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CTNNA1P35221 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CTNNA1P35221 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CTNNA1P35221 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CTNNA1P35221 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CTNNA1P35221 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CTNNA1P35221 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CTNNA1P35221 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CTNNA1P35221 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CTNNA1P35221 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CTNNA1P35221 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CTNNA1P35221 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CTNNA1P35221 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CTNNA1P35221 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CTNNA1P35221 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CTNNA1P35221 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CTNNA1P35221 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CTNNA1P35221 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CTNNA1P35221 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CTNNA1P35221 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CTNNA1P35221 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CTNNA1P35221 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CTNNA1P35221 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CTNNA1P35221 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CTNNA1P35221 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CTNNA1P35221 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CTNNA1P35221 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CTNNA1P35221 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CTNNA1P35221 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CTNNA1P35221 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CTNNA1P35221 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CTNNA1P35221 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CTNNA1P35221 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CTNNA1P35221 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CTNNA1P35221 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CTNNA1P35221 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CTNNA1P35221 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CTNNA1P35221 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CTNNA1P35221 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CTNNA1P35221 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CTNNA1P35221 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CTNNA1P35221 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CTNNA1P35221 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CTNNA1P35221 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CTNNA1P35221 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CTNNA1P35221 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CTNNA1P35221 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CTNNA1P35221 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CTNNA1P35221 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CTNNA1P35221 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CTNNA1P35221 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CTNNA1P35221 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CTNNA1P35221 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CTNNA1P35221 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CTNNA1P35221 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CTNNA1P35221 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTNNA1P35221 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTNNA1P35221 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTNNA1P35221 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTNNA1P35221 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTNNA1P35221 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTNNA1P35221 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CTNNA1P35221 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms