Protein–RNA interactions for Protein: P29373

CRABP2, Cellular retinoic acid-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP2P29373 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CRABP2P29373 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CRABP2P29373 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CRABP2P29373 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CRABP2P29373 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CRABP2P29373 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CRABP2P29373 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CRABP2P29373 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CRABP2P29373 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CRABP2P29373 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CRABP2P29373 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CRABP2P29373 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CRABP2P29373 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CRABP2P29373 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CRABP2P29373 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CRABP2P29373 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CRABP2P29373 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CRABP2P29373 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CRABP2P29373 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CRABP2P29373 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CRABP2P29373 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CRABP2P29373 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CRABP2P29373 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CRABP2P29373 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CRABP2P29373 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CRABP2P29373 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CRABP2P29373 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CRABP2P29373 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CRABP2P29373 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRABP2P29373 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CRABP2P29373 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CRABP2P29373 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CRABP2P29373 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CRABP2P29373 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CRABP2P29373 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CRABP2P29373 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CRABP2P29373 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CRABP2P29373 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CRABP2P29373 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CRABP2P29373 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CRABP2P29373 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CRABP2P29373 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CRABP2P29373 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CRABP2P29373 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CRABP2P29373 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CRABP2P29373 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CRABP2P29373 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CRABP2P29373 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CRABP2P29373 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CRABP2P29373 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CRABP2P29373 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CRABP2P29373 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CRABP2P29373 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CRABP2P29373 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CRABP2P29373 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CRABP2P29373 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CRABP2P29373 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CRABP2P29373 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CRABP2P29373 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CRABP2P29373 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CRABP2P29373 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CRABP2P29373 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CRABP2P29373 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CRABP2P29373 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CRABP2P29373 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CRABP2P29373 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CRABP2P29373 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CRABP2P29373 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CRABP2P29373 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CRABP2P29373 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
CRABP2P29373 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CRABP2P29373 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CRABP2P29373 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CRABP2P29373 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CRABP2P29373 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CRABP2P29373 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CRABP2P29373 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CRABP2P29373 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CRABP2P29373 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CRABP2P29373 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CRABP2P29373 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CRABP2P29373 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CRABP2P29373 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CRABP2P29373 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CRABP2P29373 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CRABP2P29373 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CRABP2P29373 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CRABP2P29373 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CRABP2P29373 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CRABP2P29373 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CRABP2P29373 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CRABP2P29373 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CRABP2P29373 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CRABP2P29373 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CRABP2P29373 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CRABP2P29373 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CRABP2P29373 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CRABP2P29373 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CRABP2P29373 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CRABP2P29373 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms