Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
GJB2P29033 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
GJB2P29033 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
GJB2P29033 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
GJB2P29033 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
GJB2P29033 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
GJB2P29033 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
GJB2P29033 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
GJB2P29033 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
GJB2P29033 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
GJB2P29033 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
GJB2P29033 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
GJB2P29033 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
GJB2P29033 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
GJB2P29033 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
GJB2P29033 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
GJB2P29033 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
GJB2P29033 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
GJB2P29033 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
GJB2P29033 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
GJB2P29033 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
GJB2P29033 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
GJB2P29033 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
GJB2P29033 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
GJB2P29033 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
GJB2P29033 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
GJB2P29033 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
GJB2P29033 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
GJB2P29033 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
GJB2P29033 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
GJB2P29033 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
GJB2P29033 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
GJB2P29033 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
GJB2P29033 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
GJB2P29033 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
GJB2P29033 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC31.55■■■□□ 2.64
GJB2P29033 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
GJB2P29033 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
GJB2P29033 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
GJB2P29033 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
GJB2P29033 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
GJB2P29033 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
GJB2P29033 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
GJB2P29033 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
GJB2P29033 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
GJB2P29033 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
GJB2P29033 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
GJB2P29033 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
GJB2P29033 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
GJB2P29033 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
GJB2P29033 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
GJB2P29033 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
GJB2P29033 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
GJB2P29033 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
GJB2P29033 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
GJB2P29033 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
GJB2P29033 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
GJB2P29033 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
GJB2P29033 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
GJB2P29033 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
GJB2P29033 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
GJB2P29033 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
GJB2P29033 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
GJB2P29033 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
GJB2P29033 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
GJB2P29033 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
GJB2P29033 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
GJB2P29033 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
GJB2P29033 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
GJB2P29033 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
GJB2P29033 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
GJB2P29033 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
GJB2P29033 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
GJB2P29033 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
GJB2P29033 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
GJB2P29033 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
GJB2P29033 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
GJB2P29033 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
GJB2P29033 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
GJB2P29033 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
GJB2P29033 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
GJB2P29033 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
GJB2P29033 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
GJB2P29033 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
GJB2P29033 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
GJB2P29033 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
GJB2P29033 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
GJB2P29033 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
GJB2P29033 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
GJB2P29033 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
GJB2P29033 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
GJB2P29033 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
GJB2P29033 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
GJB2P29033 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
GJB2P29033 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
GJB2P29033 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
GJB2P29033 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
GJB2P29033 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
GJB2P29033 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
GJB2P29033 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms