Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DUSP1P28562 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DUSP1P28562 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DUSP1P28562 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DUSP1P28562 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DUSP1P28562 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DUSP1P28562 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DUSP1P28562 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DUSP1P28562 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DUSP1P28562 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DUSP1P28562 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DUSP1P28562 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DUSP1P28562 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUSP1P28562 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUSP1P28562 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DUSP1P28562 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DUSP1P28562 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DUSP1P28562 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DUSP1P28562 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DUSP1P28562 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DUSP1P28562 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DUSP1P28562 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DUSP1P28562 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DUSP1P28562 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DUSP1P28562 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DUSP1P28562 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DUSP1P28562 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DUSP1P28562 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DUSP1P28562 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DUSP1P28562 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DUSP1P28562 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DUSP1P28562 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DUSP1P28562 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DUSP1P28562 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DUSP1P28562 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DUSP1P28562 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
DUSP1P28562 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DUSP1P28562 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DUSP1P28562 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DUSP1P28562 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DUSP1P28562 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DUSP1P28562 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DUSP1P28562 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUSP1P28562 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUSP1P28562 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DUSP1P28562 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DUSP1P28562 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DUSP1P28562 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DUSP1P28562 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DUSP1P28562 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DUSP1P28562 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DUSP1P28562 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
DUSP1P28562 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUSP1P28562 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUSP1P28562 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUSP1P28562 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUSP1P28562 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DUSP1P28562 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DUSP1P28562 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUSP1P28562 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUSP1P28562 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUSP1P28562 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUSP1P28562 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUSP1P28562 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DUSP1P28562 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DUSP1P28562 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
DUSP1P28562 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DUSP1P28562 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DUSP1P28562 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DUSP1P28562 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DUSP1P28562 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DUSP1P28562 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DUSP1P28562 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DUSP1P28562 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUSP1P28562 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUSP1P28562 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUSP1P28562 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DUSP1P28562 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DUSP1P28562 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
DUSP1P28562 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUSP1P28562 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUSP1P28562 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DUSP1P28562 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
DUSP1P28562 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DUSP1P28562 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DUSP1P28562 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DUSP1P28562 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DUSP1P28562 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DUSP1P28562 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUSP1P28562 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
DUSP1P28562 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUSP1P28562 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUSP1P28562 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DUSP1P28562 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DUSP1P28562 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DUSP1P28562 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DUSP1P28562 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUSP1P28562 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
DUSP1P28562 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUSP1P28562 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms