Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HTR2AP28223 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HTR2AP28223 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HTR2AP28223 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HTR2AP28223 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HTR2AP28223 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HTR2AP28223 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HTR2AP28223 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HTR2AP28223 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HTR2AP28223 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HTR2AP28223 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HTR2AP28223 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HTR2AP28223 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HTR2AP28223 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HTR2AP28223 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HTR2AP28223 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HTR2AP28223 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HTR2AP28223 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HTR2AP28223 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HTR2AP28223 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HTR2AP28223 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HTR2AP28223 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HTR2AP28223 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HTR2AP28223 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HTR2AP28223 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HTR2AP28223 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HTR2AP28223 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HTR2AP28223 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HTR2AP28223 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HTR2AP28223 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HTR2AP28223 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HTR2AP28223 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HTR2AP28223 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HTR2AP28223 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HTR2AP28223 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HTR2AP28223 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HTR2AP28223 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HTR2AP28223 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HTR2AP28223 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HTR2AP28223 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HTR2AP28223 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HTR2AP28223 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HTR2AP28223 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HTR2AP28223 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HTR2AP28223 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HTR2AP28223 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HTR2AP28223 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HTR2AP28223 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HTR2AP28223 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HTR2AP28223 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HTR2AP28223 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HTR2AP28223 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HTR2AP28223 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HTR2AP28223 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HTR2AP28223 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HTR2AP28223 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
HTR2AP28223 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HTR2AP28223 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HTR2AP28223 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HTR2AP28223 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HTR2AP28223 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HTR2AP28223 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HTR2AP28223 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HTR2AP28223 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HTR2AP28223 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HTR2AP28223 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HTR2AP28223 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HTR2AP28223 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HTR2AP28223 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HTR2AP28223 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HTR2AP28223 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HTR2AP28223 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HTR2AP28223 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HTR2AP28223 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HTR2AP28223 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HTR2AP28223 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HTR2AP28223 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HTR2AP28223 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HTR2AP28223 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HTR2AP28223 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HTR2AP28223 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HTR2AP28223 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HTR2AP28223 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HTR2AP28223 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HTR2AP28223 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HTR2AP28223 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HTR2AP28223 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HTR2AP28223 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HTR2AP28223 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HTR2AP28223 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HTR2AP28223 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HTR2AP28223 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HTR2AP28223 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HTR2AP28223 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HTR2AP28223 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HTR2AP28223 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HTR2AP28223 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HTR2AP28223 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HTR2AP28223 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HTR2AP28223 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms