Protein–RNA interactions for Protein: P28222

HTR1B, 5-hydroxytryptamine receptor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1BP28222 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HTR1BP28222 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HTR1BP28222 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HTR1BP28222 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HTR1BP28222 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
HTR1BP28222 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HTR1BP28222 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HTR1BP28222 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HTR1BP28222 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HTR1BP28222 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HTR1BP28222 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
HTR1BP28222 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HTR1BP28222 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HTR1BP28222 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HTR1BP28222 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HTR1BP28222 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HTR1BP28222 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HTR1BP28222 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HTR1BP28222 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
HTR1BP28222 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HTR1BP28222 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HTR1BP28222 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HTR1BP28222 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HTR1BP28222 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HTR1BP28222 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HTR1BP28222 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HTR1BP28222 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HTR1BP28222 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HTR1BP28222 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HTR1BP28222 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HTR1BP28222 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HTR1BP28222 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HTR1BP28222 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
HTR1BP28222 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HTR1BP28222 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HTR1BP28222 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HTR1BP28222 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HTR1BP28222 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HTR1BP28222 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HTR1BP28222 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HTR1BP28222 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
HTR1BP28222 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HTR1BP28222 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HTR1BP28222 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HTR1BP28222 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HTR1BP28222 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HTR1BP28222 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
HTR1BP28222 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HTR1BP28222 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HTR1BP28222 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HTR1BP28222 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HTR1BP28222 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HTR1BP28222 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HTR1BP28222 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
HTR1BP28222 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HTR1BP28222 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HTR1BP28222 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HTR1BP28222 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HTR1BP28222 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HTR1BP28222 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HTR1BP28222 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HTR1BP28222 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
HTR1BP28222 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HTR1BP28222 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HTR1BP28222 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
HTR1BP28222 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HTR1BP28222 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HTR1BP28222 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HTR1BP28222 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HTR1BP28222 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HTR1BP28222 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HTR1BP28222 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HTR1BP28222 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HTR1BP28222 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HTR1BP28222 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HTR1BP28222 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HTR1BP28222 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HTR1BP28222 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HTR1BP28222 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HTR1BP28222 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HTR1BP28222 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HTR1BP28222 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HTR1BP28222 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
HTR1BP28222 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HTR1BP28222 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HTR1BP28222 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HTR1BP28222 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HTR1BP28222 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
HTR1BP28222 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HTR1BP28222 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HTR1BP28222 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HTR1BP28222 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HTR1BP28222 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HTR1BP28222 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HTR1BP28222 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HTR1BP28222 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HTR1BP28222 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HTR1BP28222 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HTR1BP28222 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HTR1BP28222 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms