Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PSMB5P28074 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSMB5P28074 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PSMB5P28074 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PSMB5P28074 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PSMB5P28074 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PSMB5P28074 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PSMB5P28074 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PSMB5P28074 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PSMB5P28074 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PSMB5P28074 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PSMB5P28074 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PSMB5P28074 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PSMB5P28074 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PSMB5P28074 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PSMB5P28074 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PSMB5P28074 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSMB5P28074 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSMB5P28074 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSMB5P28074 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSMB5P28074 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSMB5P28074 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSMB5P28074 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSMB5P28074 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSMB5P28074 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSMB5P28074 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSMB5P28074 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PSMB5P28074 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PSMB5P28074 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PSMB5P28074 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PSMB5P28074 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSMB5P28074 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSMB5P28074 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSMB5P28074 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSMB5P28074 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSMB5P28074 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSMB5P28074 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSMB5P28074 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSMB5P28074 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSMB5P28074 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
PSMB5P28074 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSMB5P28074 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSMB5P28074 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSMB5P28074 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSMB5P28074 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSMB5P28074 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSMB5P28074 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSMB5P28074 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSMB5P28074 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSMB5P28074 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSMB5P28074 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSMB5P28074 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PSMB5P28074 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PSMB5P28074 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PSMB5P28074 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSMB5P28074 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSMB5P28074 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSMB5P28074 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSMB5P28074 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSMB5P28074 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSMB5P28074 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSMB5P28074 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSMB5P28074 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSMB5P28074 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSMB5P28074 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSMB5P28074 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSMB5P28074 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSMB5P28074 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSMB5P28074 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSMB5P28074 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSMB5P28074 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSMB5P28074 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSMB5P28074 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSMB5P28074 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSMB5P28074 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSMB5P28074 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSMB5P28074 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSMB5P28074 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PSMB5P28074 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSMB5P28074 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSMB5P28074 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PSMB5P28074 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PSMB5P28074 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PSMB5P28074 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PSMB5P28074 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSMB5P28074 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSMB5P28074 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSMB5P28074 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSMB5P28074 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PSMB5P28074 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSMB5P28074 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSMB5P28074 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSMB5P28074 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSMB5P28074 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSMB5P28074 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSMB5P28074 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSMB5P28074 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSMB5P28074 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSMB5P28074 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSMB5P28074 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms