Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.07■■■□□ 2.88
PSMB5P28074 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
PSMB5P28074 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
PSMB5P28074 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PSMB5P28074 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PSMB5P28074 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PSMB5P28074 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
PSMB5P28074 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PSMB5P28074 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
PSMB5P28074 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PSMB5P28074 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
PSMB5P28074 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
PSMB5P28074 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
PSMB5P28074 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PSMB5P28074 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PSMB5P28074 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PSMB5P28074 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PSMB5P28074 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PSMB5P28074 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PSMB5P28074 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PSMB5P28074 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PSMB5P28074 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PSMB5P28074 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PSMB5P28074 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PSMB5P28074 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PSMB5P28074 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PSMB5P28074 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PSMB5P28074 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PSMB5P28074 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PSMB5P28074 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PSMB5P28074 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PSMB5P28074 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PSMB5P28074 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PSMB5P28074 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PSMB5P28074 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PSMB5P28074 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PSMB5P28074 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PSMB5P28074 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PSMB5P28074 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PSMB5P28074 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PSMB5P28074 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PSMB5P28074 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PSMB5P28074 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PSMB5P28074 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PSMB5P28074 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PSMB5P28074 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PSMB5P28074 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PSMB5P28074 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PSMB5P28074 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PSMB5P28074 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PSMB5P28074 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29■■■□□ 2.23
PSMB5P28074 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PSMB5P28074 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PSMB5P28074 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PSMB5P28074 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PSMB5P28074 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PSMB5P28074 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PSMB5P28074 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PSMB5P28074 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PSMB5P28074 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PSMB5P28074 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PSMB5P28074 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PSMB5P28074 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PSMB5P28074 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PSMB5P28074 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PSMB5P28074 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PSMB5P28074 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PSMB5P28074 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PSMB5P28074 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PSMB5P28074 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PSMB5P28074 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PSMB5P28074 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PSMB5P28074 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PSMB5P28074 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PSMB5P28074 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PSMB5P28074 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PSMB5P28074 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PSMB5P28074 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PSMB5P28074 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PSMB5P28074 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PSMB5P28074 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PSMB5P28074 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PSMB5P28074 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PSMB5P28074 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PSMB5P28074 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PSMB5P28074 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PSMB5P28074 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PSMB5P28074 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PSMB5P28074 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PSMB5P28074 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PSMB5P28074 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PSMB5P28074 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PSMB5P28074 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PSMB5P28074 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PSMB5P28074 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PSMB5P28074 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PSMB5P28074 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PSMB5P28074 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PSMB5P28074 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PSMB5P28074 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms