Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PSMB4P28070 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PSMB4P28070 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PSMB4P28070 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PSMB4P28070 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PSMB4P28070 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSMB4P28070 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PSMB4P28070 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PSMB4P28070 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PSMB4P28070 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PSMB4P28070 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PSMB4P28070 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PSMB4P28070 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PSMB4P28070 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PSMB4P28070 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PSMB4P28070 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PSMB4P28070 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PSMB4P28070 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PSMB4P28070 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PSMB4P28070 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PSMB4P28070 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
PSMB4P28070 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PSMB4P28070 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PSMB4P28070 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PSMB4P28070 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PSMB4P28070 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PSMB4P28070 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PSMB4P28070 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PSMB4P28070 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PSMB4P28070 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PSMB4P28070 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PSMB4P28070 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PSMB4P28070 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PSMB4P28070 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PSMB4P28070 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PSMB4P28070 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PSMB4P28070 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PSMB4P28070 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PSMB4P28070 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PSMB4P28070 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PSMB4P28070 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PSMB4P28070 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PSMB4P28070 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PSMB4P28070 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PSMB4P28070 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PSMB4P28070 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PSMB4P28070 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PSMB4P28070 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PSMB4P28070 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PSMB4P28070 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PSMB4P28070 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PSMB4P28070 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSMB4P28070 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PSMB4P28070 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PSMB4P28070 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PSMB4P28070 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PSMB4P28070 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PSMB4P28070 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PSMB4P28070 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PSMB4P28070 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PSMB4P28070 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PSMB4P28070 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PSMB4P28070 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PSMB4P28070 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PSMB4P28070 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PSMB4P28070 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PSMB4P28070 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSMB4P28070 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSMB4P28070 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSMB4P28070 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSMB4P28070 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PSMB4P28070 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PSMB4P28070 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PSMB4P28070 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PSMB4P28070 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PSMB4P28070 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PSMB4P28070 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PSMB4P28070 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PSMB4P28070 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PSMB4P28070 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PSMB4P28070 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PSMB4P28070 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PSMB4P28070 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PSMB4P28070 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PSMB4P28070 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PSMB4P28070 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PSMB4P28070 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PSMB4P28070 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PSMB4P28070 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PSMB4P28070 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PSMB4P28070 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PSMB4P28070 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PSMB4P28070 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PSMB4P28070 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PSMB4P28070 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PSMB4P28070 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PSMB4P28070 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PSMB4P28070 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PSMB4P28070 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PSMB4P28070 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms