Protein–RNA interactions for Protein: P27986

PIK3R1, Phosphatidylinositol 3-kinase regulatory subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R1P27986 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PIK3R1P27986 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PIK3R1P27986 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PIK3R1P27986 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PIK3R1P27986 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PIK3R1P27986 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PIK3R1P27986 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PIK3R1P27986 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PIK3R1P27986 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PIK3R1P27986 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PIK3R1P27986 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PIK3R1P27986 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PIK3R1P27986 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PIK3R1P27986 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PIK3R1P27986 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PIK3R1P27986 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PIK3R1P27986 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PIK3R1P27986 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PIK3R1P27986 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PIK3R1P27986 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PIK3R1P27986 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PIK3R1P27986 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PIK3R1P27986 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PIK3R1P27986 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PIK3R1P27986 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PIK3R1P27986 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PIK3R1P27986 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PIK3R1P27986 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PIK3R1P27986 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PIK3R1P27986 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PIK3R1P27986 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PIK3R1P27986 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PIK3R1P27986 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PIK3R1P27986 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PIK3R1P27986 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PIK3R1P27986 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PIK3R1P27986 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PIK3R1P27986 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PIK3R1P27986 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PIK3R1P27986 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PIK3R1P27986 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PIK3R1P27986 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PIK3R1P27986 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PIK3R1P27986 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PIK3R1P27986 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PIK3R1P27986 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PIK3R1P27986 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PIK3R1P27986 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PIK3R1P27986 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PIK3R1P27986 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PIK3R1P27986 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PIK3R1P27986 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PIK3R1P27986 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PIK3R1P27986 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PIK3R1P27986 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PIK3R1P27986 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PIK3R1P27986 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PIK3R1P27986 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PIK3R1P27986 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PIK3R1P27986 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PIK3R1P27986 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PIK3R1P27986 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PIK3R1P27986 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PIK3R1P27986 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PIK3R1P27986 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PIK3R1P27986 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PIK3R1P27986 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PIK3R1P27986 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PIK3R1P27986 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PIK3R1P27986 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PIK3R1P27986 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PIK3R1P27986 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PIK3R1P27986 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PIK3R1P27986 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PIK3R1P27986 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PIK3R1P27986 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PIK3R1P27986 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PIK3R1P27986 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PIK3R1P27986 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PIK3R1P27986 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PIK3R1P27986 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PIK3R1P27986 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PIK3R1P27986 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PIK3R1P27986 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PIK3R1P27986 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PIK3R1P27986 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PIK3R1P27986 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PIK3R1P27986 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PIK3R1P27986 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PIK3R1P27986 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PIK3R1P27986 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PIK3R1P27986 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PIK3R1P27986 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PIK3R1P27986 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PIK3R1P27986 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PIK3R1P27986 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PIK3R1P27986 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PIK3R1P27986 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PIK3R1P27986 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PIK3R1P27986 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms