Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NFKBIAP25963 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NFKBIAP25963 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
NFKBIAP25963 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NFKBIAP25963 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NFKBIAP25963 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NFKBIAP25963 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NFKBIAP25963 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
NFKBIAP25963 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NFKBIAP25963 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NFKBIAP25963 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NFKBIAP25963 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NFKBIAP25963 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NFKBIAP25963 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
NFKBIAP25963 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NFKBIAP25963 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NFKBIAP25963 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NFKBIAP25963 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NFKBIAP25963 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NFKBIAP25963 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NFKBIAP25963 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NFKBIAP25963 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NFKBIAP25963 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NFKBIAP25963 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NFKBIAP25963 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NFKBIAP25963 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NFKBIAP25963 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NFKBIAP25963 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NFKBIAP25963 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NFKBIAP25963 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NFKBIAP25963 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NFKBIAP25963 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NFKBIAP25963 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NFKBIAP25963 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NFKBIAP25963 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NFKBIAP25963 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NFKBIAP25963 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NFKBIAP25963 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NFKBIAP25963 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NFKBIAP25963 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NFKBIAP25963 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NFKBIAP25963 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NFKBIAP25963 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NFKBIAP25963 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NFKBIAP25963 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NFKBIAP25963 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NFKBIAP25963 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
NFKBIAP25963 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NFKBIAP25963 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NFKBIAP25963 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NFKBIAP25963 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NFKBIAP25963 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NFKBIAP25963 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NFKBIAP25963 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NFKBIAP25963 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NFKBIAP25963 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NFKBIAP25963 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NFKBIAP25963 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NFKBIAP25963 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NFKBIAP25963 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NFKBIAP25963 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NFKBIAP25963 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NFKBIAP25963 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NFKBIAP25963 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NFKBIAP25963 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NFKBIAP25963 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NFKBIAP25963 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NFKBIAP25963 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
NFKBIAP25963 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NFKBIAP25963 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NFKBIAP25963 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NFKBIAP25963 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NFKBIAP25963 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NFKBIAP25963 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NFKBIAP25963 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NFKBIAP25963 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NFKBIAP25963 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NFKBIAP25963 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NFKBIAP25963 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
NFKBIAP25963 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NFKBIAP25963 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NFKBIAP25963 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NFKBIAP25963 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
NFKBIAP25963 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NFKBIAP25963 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NFKBIAP25963 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NFKBIAP25963 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NFKBIAP25963 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NFKBIAP25963 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NFKBIAP25963 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NFKBIAP25963 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NFKBIAP25963 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NFKBIAP25963 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NFKBIAP25963 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NFKBIAP25963 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NFKBIAP25963 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NFKBIAP25963 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NFKBIAP25963 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NFKBIAP25963 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NFKBIAP25963 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms