Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTSSP25774 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTSSP25774 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTSSP25774 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTSSP25774 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTSSP25774 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTSSP25774 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTSSP25774 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTSSP25774 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTSSP25774 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTSSP25774 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTSSP25774 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTSSP25774 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTSSP25774 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTSSP25774 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTSSP25774 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTSSP25774 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTSSP25774 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTSSP25774 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CTSSP25774 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTSSP25774 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTSSP25774 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTSSP25774 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTSSP25774 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTSSP25774 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTSSP25774 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTSSP25774 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTSSP25774 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTSSP25774 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CTSSP25774 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTSSP25774 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTSSP25774 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTSSP25774 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTSSP25774 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTSSP25774 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CTSSP25774 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTSSP25774 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTSSP25774 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTSSP25774 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTSSP25774 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTSSP25774 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CTSSP25774 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTSSP25774 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTSSP25774 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTSSP25774 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTSSP25774 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CTSSP25774 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTSSP25774 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTSSP25774 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTSSP25774 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTSSP25774 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTSSP25774 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTSSP25774 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTSSP25774 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTSSP25774 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CTSSP25774 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTSSP25774 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTSSP25774 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTSSP25774 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTSSP25774 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CTSSP25774 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
CTSSP25774 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTSSP25774 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTSSP25774 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTSSP25774 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTSSP25774 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTSSP25774 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTSSP25774 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTSSP25774 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTSSP25774 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTSSP25774 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTSSP25774 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTSSP25774 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTSSP25774 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTSSP25774 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTSSP25774 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTSSP25774 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTSSP25774 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTSSP25774 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTSSP25774 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTSSP25774 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTSSP25774 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CTSSP25774 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CTSSP25774 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTSSP25774 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTSSP25774 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTSSP25774 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTSSP25774 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTSSP25774 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTSSP25774 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTSSP25774 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTSSP25774 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTSSP25774 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTSSP25774 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTSSP25774 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTSSP25774 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CTSSP25774 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CTSSP25774 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CTSSP25774 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTSSP25774 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms