Protein–RNA interactions for Protein: P25106

ACKR3, Atypical chemokine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR3P25106 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACKR3P25106 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACKR3P25106 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACKR3P25106 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACKR3P25106 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACKR3P25106 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACKR3P25106 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACKR3P25106 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACKR3P25106 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACKR3P25106 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACKR3P25106 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACKR3P25106 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACKR3P25106 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACKR3P25106 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACKR3P25106 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACKR3P25106 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACKR3P25106 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACKR3P25106 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACKR3P25106 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACKR3P25106 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACKR3P25106 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACKR3P25106 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACKR3P25106 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACKR3P25106 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACKR3P25106 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACKR3P25106 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACKR3P25106 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACKR3P25106 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACKR3P25106 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ACKR3P25106 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ACKR3P25106 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACKR3P25106 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACKR3P25106 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACKR3P25106 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACKR3P25106 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACKR3P25106 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACKR3P25106 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACKR3P25106 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ACKR3P25106 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACKR3P25106 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACKR3P25106 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ACKR3P25106 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACKR3P25106 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACKR3P25106 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACKR3P25106 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACKR3P25106 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACKR3P25106 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACKR3P25106 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACKR3P25106 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ACKR3P25106 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACKR3P25106 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACKR3P25106 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACKR3P25106 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACKR3P25106 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACKR3P25106 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACKR3P25106 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACKR3P25106 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACKR3P25106 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACKR3P25106 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACKR3P25106 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACKR3P25106 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACKR3P25106 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ACKR3P25106 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACKR3P25106 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACKR3P25106 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACKR3P25106 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACKR3P25106 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACKR3P25106 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACKR3P25106 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACKR3P25106 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACKR3P25106 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACKR3P25106 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACKR3P25106 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACKR3P25106 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ACKR3P25106 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACKR3P25106 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACKR3P25106 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACKR3P25106 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACKR3P25106 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACKR3P25106 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACKR3P25106 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACKR3P25106 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACKR3P25106 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACKR3P25106 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACKR3P25106 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACKR3P25106 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACKR3P25106 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACKR3P25106 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACKR3P25106 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ACKR3P25106 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACKR3P25106 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACKR3P25106 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACKR3P25106 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACKR3P25106 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACKR3P25106 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACKR3P25106 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACKR3P25106 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACKR3P25106 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ACKR3P25106 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACKR3P25106 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms