Protein–RNA interactions for Protein: P24347

MMP11, Stromelysin-3, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP11P24347 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MMP11P24347 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MMP11P24347 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MMP11P24347 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MMP11P24347 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MMP11P24347 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
MMP11P24347 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MMP11P24347 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MMP11P24347 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MMP11P24347 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MMP11P24347 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MMP11P24347 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MMP11P24347 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
MMP11P24347 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MMP11P24347 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
MMP11P24347 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
MMP11P24347 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
MMP11P24347 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MMP11P24347 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MMP11P24347 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MMP11P24347 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
MMP11P24347 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MMP11P24347 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MMP11P24347 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MMP11P24347 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MMP11P24347 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MMP11P24347 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MMP11P24347 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MMP11P24347 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MMP11P24347 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MMP11P24347 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MMP11P24347 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MMP11P24347 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MMP11P24347 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MMP11P24347 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MMP11P24347 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MMP11P24347 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MMP11P24347 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MMP11P24347 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MMP11P24347 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MMP11P24347 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MMP11P24347 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MMP11P24347 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
MMP11P24347 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
MMP11P24347 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MMP11P24347 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MMP11P24347 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MMP11P24347 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MMP11P24347 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MMP11P24347 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MMP11P24347 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MMP11P24347 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MMP11P24347 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MMP11P24347 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MMP11P24347 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MMP11P24347 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
MMP11P24347 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MMP11P24347 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MMP11P24347 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MMP11P24347 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MMP11P24347 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MMP11P24347 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MMP11P24347 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MMP11P24347 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MMP11P24347 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MMP11P24347 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MMP11P24347 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MMP11P24347 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MMP11P24347 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MMP11P24347 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MMP11P24347 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
MMP11P24347 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MMP11P24347 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
MMP11P24347 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MMP11P24347 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
MMP11P24347 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MMP11P24347 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MMP11P24347 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MMP11P24347 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MMP11P24347 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
MMP11P24347 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MMP11P24347 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MMP11P24347 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MMP11P24347 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MMP11P24347 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MMP11P24347 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MMP11P24347 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MMP11P24347 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MMP11P24347 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MMP11P24347 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MMP11P24347 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MMP11P24347 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MMP11P24347 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MMP11P24347 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MMP11P24347 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MMP11P24347 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MMP11P24347 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MMP11P24347 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MMP11P24347 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MMP11P24347 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms