Protein–RNA interactions for Protein: P24158

PRTN3, Myeloblastin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRTN3P24158 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRTN3P24158 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PRTN3P24158 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRTN3P24158 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRTN3P24158 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRTN3P24158 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRTN3P24158 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRTN3P24158 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRTN3P24158 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRTN3P24158 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRTN3P24158 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRTN3P24158 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRTN3P24158 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRTN3P24158 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PRTN3P24158 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRTN3P24158 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRTN3P24158 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRTN3P24158 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRTN3P24158 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRTN3P24158 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRTN3P24158 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PRTN3P24158 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRTN3P24158 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRTN3P24158 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRTN3P24158 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PRTN3P24158 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRTN3P24158 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRTN3P24158 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRTN3P24158 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRTN3P24158 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRTN3P24158 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRTN3P24158 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRTN3P24158 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRTN3P24158 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRTN3P24158 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRTN3P24158 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRTN3P24158 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRTN3P24158 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRTN3P24158 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRTN3P24158 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRTN3P24158 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRTN3P24158 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRTN3P24158 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRTN3P24158 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRTN3P24158 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRTN3P24158 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRTN3P24158 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRTN3P24158 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRTN3P24158 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRTN3P24158 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRTN3P24158 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRTN3P24158 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PRTN3P24158 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRTN3P24158 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PRTN3P24158 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRTN3P24158 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRTN3P24158 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PRTN3P24158 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PRTN3P24158 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRTN3P24158 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRTN3P24158 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRTN3P24158 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRTN3P24158 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRTN3P24158 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PRTN3P24158 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRTN3P24158 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRTN3P24158 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRTN3P24158 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PRTN3P24158 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PRTN3P24158 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRTN3P24158 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRTN3P24158 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRTN3P24158 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRTN3P24158 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRTN3P24158 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRTN3P24158 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRTN3P24158 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRTN3P24158 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRTN3P24158 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRTN3P24158 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRTN3P24158 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRTN3P24158 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRTN3P24158 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRTN3P24158 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRTN3P24158 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRTN3P24158 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRTN3P24158 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRTN3P24158 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRTN3P24158 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRTN3P24158 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRTN3P24158 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRTN3P24158 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRTN3P24158 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRTN3P24158 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRTN3P24158 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRTN3P24158 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRTN3P24158 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRTN3P24158 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRTN3P24158 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRTN3P24158 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms