Protein–RNA interactions for Protein: P23378

GLDC, Glycine dehydrogenase (decarboxylating), mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLDCP23378 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GLDCP23378 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GLDCP23378 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GLDCP23378 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GLDCP23378 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GLDCP23378 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GLDCP23378 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GLDCP23378 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GLDCP23378 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
GLDCP23378 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GLDCP23378 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GLDCP23378 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GLDCP23378 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GLDCP23378 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
GLDCP23378 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GLDCP23378 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GLDCP23378 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GLDCP23378 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GLDCP23378 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GLDCP23378 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GLDCP23378 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GLDCP23378 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GLDCP23378 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
GLDCP23378 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GLDCP23378 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GLDCP23378 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GLDCP23378 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GLDCP23378 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GLDCP23378 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GLDCP23378 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GLDCP23378 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GLDCP23378 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GLDCP23378 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GLDCP23378 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GLDCP23378 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GLDCP23378 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GLDCP23378 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GLDCP23378 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GLDCP23378 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GLDCP23378 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GLDCP23378 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GLDCP23378 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GLDCP23378 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GLDCP23378 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GLDCP23378 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GLDCP23378 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GLDCP23378 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GLDCP23378 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GLDCP23378 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GLDCP23378 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GLDCP23378 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GLDCP23378 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GLDCP23378 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GLDCP23378 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
GLDCP23378 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GLDCP23378 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
GLDCP23378 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GLDCP23378 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GLDCP23378 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GLDCP23378 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GLDCP23378 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GLDCP23378 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GLDCP23378 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GLDCP23378 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GLDCP23378 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GLDCP23378 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GLDCP23378 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
GLDCP23378 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GLDCP23378 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.55■■■□□ 2
GLDCP23378 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GLDCP23378 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GLDCP23378 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GLDCP23378 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.52■■■□□ 2
GLDCP23378 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GLDCP23378 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
GLDCP23378 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GLDCP23378 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GLDCP23378 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GLDCP23378 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GLDCP23378 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GLDCP23378 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GLDCP23378 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GLDCP23378 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GLDCP23378 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GLDCP23378 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
GLDCP23378 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GLDCP23378 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GLDCP23378 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GLDCP23378 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GLDCP23378 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GLDCP23378 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GLDCP23378 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GLDCP23378 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GLDCP23378 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
GLDCP23378 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GLDCP23378 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GLDCP23378 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GLDCP23378 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GLDCP23378 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GLDCP23378 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms