Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC42.14■■■■■ 4.34
HRCP23327 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC42.13■■■■■ 4.33
HRCP23327 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
HRCP23327 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC42.11■■■■■ 4.33
HRCP23327 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC42.11■■■■■ 4.33
HRCP23327 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
HRCP23327 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
HRCP23327 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.07■■■■■ 4.33
HRCP23327 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.05■■■■■ 4.32
HRCP23327 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.04■■■■■ 4.32
HRCP23327 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
HRCP23327 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC42.01■■■■■ 4.32
HRCP23327 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
HRCP23327 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
HRCP23327 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
HRCP23327 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
HRCP23327 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC41.95■■■■■ 4.31
HRCP23327 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC41.95■■■■■ 4.31
HRCP23327 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
HRCP23327 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.93■■■■■ 4.3
HRCP23327 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
HRCP23327 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC41.92■■■■■ 4.3
HRCP23327 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
HRCP23327 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC41.91■■■■■ 4.3
HRCP23327 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC41.91■■■■■ 4.3
HRCP23327 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
HRCP23327 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.87■■■■■ 4.29
HRCP23327 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
HRCP23327 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
HRCP23327 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
HRCP23327 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
HRCP23327 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
HRCP23327 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
HRCP23327 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC41.81■■■■■ 4.28
HRCP23327 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
HRCP23327 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
HRCP23327 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.78■■■■■ 4.28
HRCP23327 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.76■■■■■ 4.28
HRCP23327 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
HRCP23327 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC41.76■■■■■ 4.27
HRCP23327 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.75■■■■■ 4.27
HRCP23327 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
HRCP23327 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
HRCP23327 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
HRCP23327 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC41.74■■■■■ 4.27
HRCP23327 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
HRCP23327 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC41.72■■■■■ 4.27
HRCP23327 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC41.72■■■■■ 4.27
HRCP23327 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.71■■■■■ 4.27
HRCP23327 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
HRCP23327 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC41.66■■■■■ 4.26
HRCP23327 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
HRCP23327 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
HRCP23327 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
HRCP23327 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC41.64■■■■■ 4.26
HRCP23327 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
HRCP23327 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.63■■■■■ 4.26
HRCP23327 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
HRCP23327 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
HRCP23327 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC41.61■■■■■ 4.25
HRCP23327 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.59■■■■■ 4.25
HRCP23327 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
HRCP23327 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC41.59■■■■■ 4.25
HRCP23327 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
HRCP23327 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
HRCP23327 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.58■■■■■ 4.25
HRCP23327 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC41.57■■■■■ 4.25
HRCP23327 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC41.55■■■■■ 4.24
HRCP23327 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.55■■■■■ 4.24
HRCP23327 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
HRCP23327 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
HRCP23327 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC41.54■■■■■ 4.24
HRCP23327 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC41.52■■■■■ 4.24
HRCP23327 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
HRCP23327 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC41.51■■■■■ 4.24
HRCP23327 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
HRCP23327 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
HRCP23327 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
HRCP23327 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
HRCP23327 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
HRCP23327 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC41.49■■■■■ 4.23
HRCP23327 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
HRCP23327 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.47■■■■■ 4.23
HRCP23327 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
HRCP23327 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
HRCP23327 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
HRCP23327 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.43■■■■■ 4.22
HRCP23327 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
HRCP23327 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC41.42■■■■■ 4.22
HRCP23327 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
HRCP23327 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
HRCP23327 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
HRCP23327 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
HRCP23327 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
HRCP23327 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
HRCP23327 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC41.38■■■■■ 4.21
HRCP23327 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
HRCP23327 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
HRCP23327 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
HRCP23327 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC41.34■■■■■ 4.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms