Protein–RNA interactions for Protein: P20340

RAB6A, Ras-related protein Rab-6A, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6AP20340 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB6AP20340 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB6AP20340 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB6AP20340 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB6AP20340 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB6AP20340 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB6AP20340 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB6AP20340 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB6AP20340 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB6AP20340 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB6AP20340 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB6AP20340 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB6AP20340 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB6AP20340 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB6AP20340 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB6AP20340 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB6AP20340 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB6AP20340 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB6AP20340 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB6AP20340 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB6AP20340 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB6AP20340 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB6AP20340 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB6AP20340 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB6AP20340 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB6AP20340 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB6AP20340 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB6AP20340 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB6AP20340 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB6AP20340 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB6AP20340 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB6AP20340 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB6AP20340 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB6AP20340 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB6AP20340 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB6AP20340 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB6AP20340 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB6AP20340 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB6AP20340 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB6AP20340 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB6AP20340 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB6AP20340 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB6AP20340 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB6AP20340 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB6AP20340 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB6AP20340 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB6AP20340 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB6AP20340 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB6AP20340 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB6AP20340 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB6AP20340 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB6AP20340 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB6AP20340 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB6AP20340 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB6AP20340 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB6AP20340 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB6AP20340 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB6AP20340 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB6AP20340 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB6AP20340 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB6AP20340 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB6AP20340 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB6AP20340 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB6AP20340 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB6AP20340 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB6AP20340 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB6AP20340 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB6AP20340 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB6AP20340 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB6AP20340 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB6AP20340 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB6AP20340 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB6AP20340 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB6AP20340 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB6AP20340 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB6AP20340 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB6AP20340 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB6AP20340 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB6AP20340 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB6AP20340 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB6AP20340 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB6AP20340 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB6AP20340 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB6AP20340 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB6AP20340 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB6AP20340 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB6AP20340 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB6AP20340 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB6AP20340 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB6AP20340 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB6AP20340 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB6AP20340 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB6AP20340 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB6AP20340 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB6AP20340 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB6AP20340 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB6AP20340 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB6AP20340 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB6AP20340 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB6AP20340 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms