Protein–RNA interactions for Protein: P20340

RAB6A, Ras-related protein Rab-6A, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6AP20340 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RAB6AP20340 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RAB6AP20340 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RAB6AP20340 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RAB6AP20340 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RAB6AP20340 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RAB6AP20340 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
RAB6AP20340 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAB6AP20340 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RAB6AP20340 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RAB6AP20340 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RAB6AP20340 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAB6AP20340 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RAB6AP20340 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAB6AP20340 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RAB6AP20340 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAB6AP20340 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RAB6AP20340 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAB6AP20340 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAB6AP20340 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RAB6AP20340 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAB6AP20340 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RAB6AP20340 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAB6AP20340 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAB6AP20340 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAB6AP20340 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAB6AP20340 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAB6AP20340 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RAB6AP20340 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAB6AP20340 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAB6AP20340 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAB6AP20340 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAB6AP20340 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAB6AP20340 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAB6AP20340 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAB6AP20340 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB6AP20340 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAB6AP20340 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB6AP20340 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAB6AP20340 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAB6AP20340 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB6AP20340 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB6AP20340 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB6AP20340 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB6AP20340 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB6AP20340 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB6AP20340 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB6AP20340 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB6AP20340 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB6AP20340 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RAB6AP20340 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB6AP20340 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAB6AP20340 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB6AP20340 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB6AP20340 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB6AP20340 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB6AP20340 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB6AP20340 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAB6AP20340 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB6AP20340 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB6AP20340 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB6AP20340 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB6AP20340 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB6AP20340 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB6AP20340 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB6AP20340 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB6AP20340 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB6AP20340 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB6AP20340 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB6AP20340 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB6AP20340 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB6AP20340 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB6AP20340 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RAB6AP20340 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB6AP20340 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB6AP20340 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB6AP20340 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB6AP20340 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB6AP20340 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB6AP20340 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAB6AP20340 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB6AP20340 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB6AP20340 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB6AP20340 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB6AP20340 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB6AP20340 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB6AP20340 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB6AP20340 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB6AP20340 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB6AP20340 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB6AP20340 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB6AP20340 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB6AP20340 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB6AP20340 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB6AP20340 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB6AP20340 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB6AP20340 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB6AP20340 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB6AP20340 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB6AP20340 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms