Protein–RNA interactions for Protein: P19438

TNFRSF1A, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1A, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF1AP19438 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF1AP19438 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF1AP19438 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF1AP19438 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF1AP19438 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF1AP19438 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF1AP19438 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF1AP19438 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF1AP19438 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF1AP19438 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF1AP19438 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFRSF1AP19438 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFRSF1AP19438 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFRSF1AP19438 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFRSF1AP19438 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFRSF1AP19438 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFRSF1AP19438 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFRSF1AP19438 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFRSF1AP19438 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFRSF1AP19438 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNFRSF1AP19438 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFRSF1AP19438 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFRSF1AP19438 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFRSF1AP19438 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFRSF1AP19438 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFRSF1AP19438 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFRSF1AP19438 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFRSF1AP19438 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFRSF1AP19438 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFRSF1AP19438 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFRSF1AP19438 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFRSF1AP19438 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TNFRSF1AP19438 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFRSF1AP19438 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFRSF1AP19438 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFRSF1AP19438 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFRSF1AP19438 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFRSF1AP19438 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFRSF1AP19438 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF1AP19438 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF1AP19438 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFRSF1AP19438 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFRSF1AP19438 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFRSF1AP19438 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF1AP19438 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF1AP19438 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF1AP19438 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF1AP19438 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF1AP19438 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF1AP19438 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFRSF1AP19438 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFRSF1AP19438 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF1AP19438 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF1AP19438 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFRSF1AP19438 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFRSF1AP19438 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFRSF1AP19438 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFRSF1AP19438 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFRSF1AP19438 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFRSF1AP19438 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFRSF1AP19438 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFRSF1AP19438 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFRSF1AP19438 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFRSF1AP19438 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFRSF1AP19438 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFRSF1AP19438 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFRSF1AP19438 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFRSF1AP19438 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFRSF1AP19438 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFRSF1AP19438 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFRSF1AP19438 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFRSF1AP19438 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFRSF1AP19438 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFRSF1AP19438 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFRSF1AP19438 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFRSF1AP19438 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFRSF1AP19438 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFRSF1AP19438 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNFRSF1AP19438 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNFRSF1AP19438 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNFRSF1AP19438 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFRSF1AP19438 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFRSF1AP19438 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFRSF1AP19438 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFRSF1AP19438 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFRSF1AP19438 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFRSF1AP19438 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFRSF1AP19438 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFRSF1AP19438 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFRSF1AP19438 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFRSF1AP19438 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFRSF1AP19438 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF1AP19438 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF1AP19438 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF1AP19438 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF1AP19438 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF1AP19438 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF1AP19438 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF1AP19438 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF1AP19438 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms