Protein–RNA interactions for Protein: P19113

HDC, Histidine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDCP19113 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HDCP19113 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HDCP19113 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HDCP19113 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HDCP19113 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HDCP19113 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
HDCP19113 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HDCP19113 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HDCP19113 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HDCP19113 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HDCP19113 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HDCP19113 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HDCP19113 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HDCP19113 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HDCP19113 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HDCP19113 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
HDCP19113 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HDCP19113 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
HDCP19113 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HDCP19113 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HDCP19113 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HDCP19113 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HDCP19113 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HDCP19113 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
HDCP19113 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HDCP19113 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HDCP19113 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HDCP19113 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HDCP19113 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HDCP19113 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HDCP19113 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HDCP19113 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HDCP19113 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HDCP19113 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HDCP19113 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HDCP19113 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HDCP19113 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HDCP19113 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HDCP19113 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HDCP19113 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HDCP19113 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HDCP19113 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HDCP19113 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HDCP19113 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HDCP19113 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
HDCP19113 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HDCP19113 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HDCP19113 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HDCP19113 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HDCP19113 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HDCP19113 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HDCP19113 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HDCP19113 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HDCP19113 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HDCP19113 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HDCP19113 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HDCP19113 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HDCP19113 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
HDCP19113 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HDCP19113 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HDCP19113 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HDCP19113 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HDCP19113 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HDCP19113 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HDCP19113 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HDCP19113 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HDCP19113 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HDCP19113 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HDCP19113 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HDCP19113 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HDCP19113 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
HDCP19113 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HDCP19113 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
HDCP19113 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HDCP19113 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HDCP19113 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HDCP19113 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HDCP19113 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HDCP19113 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HDCP19113 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HDCP19113 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HDCP19113 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HDCP19113 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HDCP19113 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HDCP19113 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
HDCP19113 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HDCP19113 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HDCP19113 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HDCP19113 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HDCP19113 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HDCP19113 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HDCP19113 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HDCP19113 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HDCP19113 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HDCP19113 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HDCP19113 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
HDCP19113 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HDCP19113 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HDCP19113 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HDCP19113 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms