Protein–RNA interactions for Protein: P18754

RCC1, Regulator of chromosome condensation, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCC1P18754 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RCC1P18754 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RCC1P18754 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RCC1P18754 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RCC1P18754 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RCC1P18754 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RCC1P18754 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RCC1P18754 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RCC1P18754 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RCC1P18754 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RCC1P18754 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RCC1P18754 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RCC1P18754 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RCC1P18754 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RCC1P18754 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RCC1P18754 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RCC1P18754 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RCC1P18754 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RCC1P18754 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RCC1P18754 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RCC1P18754 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RCC1P18754 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RCC1P18754 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RCC1P18754 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RCC1P18754 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RCC1P18754 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RCC1P18754 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RCC1P18754 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RCC1P18754 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RCC1P18754 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RCC1P18754 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RCC1P18754 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RCC1P18754 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RCC1P18754 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RCC1P18754 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RCC1P18754 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RCC1P18754 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RCC1P18754 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RCC1P18754 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RCC1P18754 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RCC1P18754 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RCC1P18754 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RCC1P18754 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RCC1P18754 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RCC1P18754 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RCC1P18754 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RCC1P18754 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RCC1P18754 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RCC1P18754 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RCC1P18754 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RCC1P18754 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RCC1P18754 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RCC1P18754 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RCC1P18754 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RCC1P18754 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RCC1P18754 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RCC1P18754 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RCC1P18754 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RCC1P18754 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RCC1P18754 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RCC1P18754 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RCC1P18754 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RCC1P18754 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RCC1P18754 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RCC1P18754 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RCC1P18754 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RCC1P18754 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RCC1P18754 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RCC1P18754 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RCC1P18754 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RCC1P18754 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RCC1P18754 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RCC1P18754 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RCC1P18754 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RCC1P18754 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RCC1P18754 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RCC1P18754 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RCC1P18754 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RCC1P18754 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RCC1P18754 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RCC1P18754 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RCC1P18754 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RCC1P18754 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCC1P18754 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCC1P18754 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RCC1P18754 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RCC1P18754 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RCC1P18754 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RCC1P18754 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RCC1P18754 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RCC1P18754 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RCC1P18754 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RCC1P18754 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RCC1P18754 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RCC1P18754 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RCC1P18754 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RCC1P18754 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RCC1P18754 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RCC1P18754 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RCC1P18754 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms