Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPN1P18031 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPN1P18031 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPN1P18031 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPN1P18031 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPN1P18031 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPN1P18031 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPN1P18031 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPN1P18031 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPN1P18031 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPN1P18031 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPN1P18031 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPN1P18031 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPN1P18031 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPN1P18031 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPN1P18031 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPN1P18031 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPN1P18031 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPN1P18031 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPN1P18031 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPN1P18031 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPN1P18031 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPN1P18031 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPN1P18031 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPN1P18031 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPN1P18031 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPN1P18031 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPN1P18031 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPN1P18031 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPN1P18031 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPN1P18031 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPN1P18031 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPN1P18031 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PTPN1P18031 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PTPN1P18031 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PTPN1P18031 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPN1P18031 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPN1P18031 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPN1P18031 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPN1P18031 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPN1P18031 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTPN1P18031 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPN1P18031 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPN1P18031 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPN1P18031 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPN1P18031 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPN1P18031 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPN1P18031 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPN1P18031 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPN1P18031 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPN1P18031 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPN1P18031 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPN1P18031 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPN1P18031 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPN1P18031 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPN1P18031 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPN1P18031 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPN1P18031 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPN1P18031 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPN1P18031 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPN1P18031 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPN1P18031 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPN1P18031 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPN1P18031 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPN1P18031 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPN1P18031 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPN1P18031 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPN1P18031 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPN1P18031 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPN1P18031 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPN1P18031 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPN1P18031 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPN1P18031 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPN1P18031 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPN1P18031 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPN1P18031 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPN1P18031 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPN1P18031 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPN1P18031 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPN1P18031 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPN1P18031 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPN1P18031 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPN1P18031 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPN1P18031 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPN1P18031 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPN1P18031 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPN1P18031 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPN1P18031 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTPN1P18031 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTPN1P18031 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
PTPN1P18031 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTPN1P18031 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPN1P18031 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPN1P18031 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPN1P18031 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPN1P18031 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPN1P18031 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPN1P18031 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPN1P18031 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPN1P18031 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms