Protein–RNA interactions for Protein: P15622

ZNF250, Zinc finger protein 250, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF250P15622 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF250P15622 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF250P15622 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF250P15622 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF250P15622 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF250P15622 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF250P15622 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF250P15622 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF250P15622 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF250P15622 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF250P15622 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF250P15622 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF250P15622 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF250P15622 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF250P15622 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF250P15622 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF250P15622 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF250P15622 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF250P15622 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF250P15622 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF250P15622 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF250P15622 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF250P15622 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF250P15622 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF250P15622 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF250P15622 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF250P15622 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF250P15622 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF250P15622 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF250P15622 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF250P15622 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF250P15622 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF250P15622 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF250P15622 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF250P15622 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZNF250P15622 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF250P15622 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF250P15622 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF250P15622 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF250P15622 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF250P15622 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF250P15622 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF250P15622 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF250P15622 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF250P15622 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF250P15622 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF250P15622 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF250P15622 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF250P15622 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF250P15622 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF250P15622 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF250P15622 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF250P15622 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF250P15622 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF250P15622 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF250P15622 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF250P15622 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF250P15622 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF250P15622 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF250P15622 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF250P15622 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF250P15622 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZNF250P15622 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF250P15622 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF250P15622 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF250P15622 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF250P15622 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF250P15622 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF250P15622 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF250P15622 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF250P15622 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF250P15622 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF250P15622 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF250P15622 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF250P15622 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF250P15622 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF250P15622 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF250P15622 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF250P15622 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF250P15622 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF250P15622 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF250P15622 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF250P15622 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF250P15622 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF250P15622 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF250P15622 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNF250P15622 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNF250P15622 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF250P15622 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF250P15622 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF250P15622 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF250P15622 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF250P15622 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF250P15622 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF250P15622 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF250P15622 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF250P15622 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF250P15622 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF250P15622 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF250P15622 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms