Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
VAV1P15498 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
VAV1P15498 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
VAV1P15498 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VAV1P15498 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VAV1P15498 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VAV1P15498 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
VAV1P15498 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VAV1P15498 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
VAV1P15498 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
VAV1P15498 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
VAV1P15498 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
VAV1P15498 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
VAV1P15498 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
VAV1P15498 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
VAV1P15498 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
VAV1P15498 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
VAV1P15498 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
VAV1P15498 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VAV1P15498 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
VAV1P15498 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
VAV1P15498 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
VAV1P15498 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VAV1P15498 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VAV1P15498 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VAV1P15498 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
VAV1P15498 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
VAV1P15498 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
VAV1P15498 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
VAV1P15498 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
VAV1P15498 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
VAV1P15498 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VAV1P15498 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
VAV1P15498 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
VAV1P15498 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
VAV1P15498 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
VAV1P15498 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
VAV1P15498 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VAV1P15498 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VAV1P15498 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
VAV1P15498 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VAV1P15498 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VAV1P15498 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
VAV1P15498 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
VAV1P15498 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
VAV1P15498 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
VAV1P15498 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
VAV1P15498 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
VAV1P15498 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
VAV1P15498 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
VAV1P15498 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
VAV1P15498 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VAV1P15498 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VAV1P15498 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
VAV1P15498 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
VAV1P15498 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
VAV1P15498 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
VAV1P15498 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
VAV1P15498 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
VAV1P15498 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VAV1P15498 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
VAV1P15498 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
VAV1P15498 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
VAV1P15498 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.04
VAV1P15498 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
VAV1P15498 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
VAV1P15498 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
VAV1P15498 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
VAV1P15498 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
VAV1P15498 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
VAV1P15498 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
VAV1P15498 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
VAV1P15498 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
VAV1P15498 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
VAV1P15498 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
VAV1P15498 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
VAV1P15498 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
VAV1P15498 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
VAV1P15498 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
VAV1P15498 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
VAV1P15498 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
VAV1P15498 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
VAV1P15498 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
VAV1P15498 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
VAV1P15498 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
VAV1P15498 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
VAV1P15498 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
VAV1P15498 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
VAV1P15498 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
VAV1P15498 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VAV1P15498 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VAV1P15498 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
VAV1P15498 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
VAV1P15498 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
VAV1P15498 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
VAV1P15498 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
VAV1P15498 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
VAV1P15498 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
VAV1P15498 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
VAV1P15498 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms