Protein–RNA interactions for Protein: P14317

HCLS1, Hematopoietic lineage cell-specific protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1P14317 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
HCLS1P14317 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
HCLS1P14317 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
HCLS1P14317 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
HCLS1P14317 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
HCLS1P14317 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
HCLS1P14317 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
HCLS1P14317 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
HCLS1P14317 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
HCLS1P14317 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
HCLS1P14317 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
HCLS1P14317 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
HCLS1P14317 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
HCLS1P14317 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
HCLS1P14317 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
HCLS1P14317 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
HCLS1P14317 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
HCLS1P14317 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
HCLS1P14317 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
HCLS1P14317 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
HCLS1P14317 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
HCLS1P14317 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
HCLS1P14317 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
HCLS1P14317 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
HCLS1P14317 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
HCLS1P14317 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
HCLS1P14317 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
HCLS1P14317 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
HCLS1P14317 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
HCLS1P14317 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
HCLS1P14317 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
HCLS1P14317 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
HCLS1P14317 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
HCLS1P14317 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
HCLS1P14317 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
HCLS1P14317 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
HCLS1P14317 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
HCLS1P14317 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
HCLS1P14317 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
HCLS1P14317 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
HCLS1P14317 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
HCLS1P14317 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
HCLS1P14317 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
HCLS1P14317 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
HCLS1P14317 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
HCLS1P14317 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
HCLS1P14317 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
HCLS1P14317 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
HCLS1P14317 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
HCLS1P14317 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
HCLS1P14317 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
HCLS1P14317 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
HCLS1P14317 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
HCLS1P14317 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
HCLS1P14317 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
HCLS1P14317 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
HCLS1P14317 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
HCLS1P14317 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
HCLS1P14317 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
HCLS1P14317 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
HCLS1P14317 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
HCLS1P14317 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
HCLS1P14317 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
HCLS1P14317 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
HCLS1P14317 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
HCLS1P14317 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
HCLS1P14317 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
HCLS1P14317 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
HCLS1P14317 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
HCLS1P14317 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
HCLS1P14317 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC33.91■■■■□ 3.02
HCLS1P14317 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
HCLS1P14317 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
HCLS1P14317 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
HCLS1P14317 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
HCLS1P14317 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
HCLS1P14317 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
HCLS1P14317 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
HCLS1P14317 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
HCLS1P14317 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
HCLS1P14317 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
HCLS1P14317 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
HCLS1P14317 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
HCLS1P14317 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
HCLS1P14317 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
HCLS1P14317 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
HCLS1P14317 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
HCLS1P14317 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
HCLS1P14317 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
HCLS1P14317 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
HCLS1P14317 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
HCLS1P14317 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
HCLS1P14317 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
HCLS1P14317 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
HCLS1P14317 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
HCLS1P14317 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
HCLS1P14317 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
HCLS1P14317 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
HCLS1P14317 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC33.73■■■□□ 2.99
HCLS1P14317 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms