Protein–RNA interactions for Protein: P13349

MYF5, Myogenic factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF5P13349 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MYF5P13349 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
MYF5P13349 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MYF5P13349 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MYF5P13349 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MYF5P13349 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MYF5P13349 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MYF5P13349 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MYF5P13349 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MYF5P13349 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MYF5P13349 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MYF5P13349 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MYF5P13349 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MYF5P13349 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MYF5P13349 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MYF5P13349 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MYF5P13349 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MYF5P13349 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MYF5P13349 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MYF5P13349 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MYF5P13349 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MYF5P13349 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MYF5P13349 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MYF5P13349 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MYF5P13349 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MYF5P13349 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MYF5P13349 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MYF5P13349 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MYF5P13349 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MYF5P13349 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MYF5P13349 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MYF5P13349 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MYF5P13349 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MYF5P13349 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MYF5P13349 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MYF5P13349 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MYF5P13349 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MYF5P13349 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MYF5P13349 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MYF5P13349 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MYF5P13349 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MYF5P13349 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MYF5P13349 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MYF5P13349 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MYF5P13349 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MYF5P13349 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
MYF5P13349 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MYF5P13349 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MYF5P13349 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MYF5P13349 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MYF5P13349 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MYF5P13349 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MYF5P13349 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MYF5P13349 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
MYF5P13349 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MYF5P13349 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MYF5P13349 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MYF5P13349 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MYF5P13349 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MYF5P13349 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MYF5P13349 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MYF5P13349 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MYF5P13349 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MYF5P13349 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MYF5P13349 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MYF5P13349 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MYF5P13349 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MYF5P13349 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
MYF5P13349 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MYF5P13349 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MYF5P13349 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MYF5P13349 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MYF5P13349 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MYF5P13349 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MYF5P13349 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MYF5P13349 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MYF5P13349 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MYF5P13349 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MYF5P13349 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MYF5P13349 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MYF5P13349 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MYF5P13349 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MYF5P13349 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MYF5P13349 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MYF5P13349 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MYF5P13349 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
MYF5P13349 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MYF5P13349 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MYF5P13349 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MYF5P13349 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MYF5P13349 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MYF5P13349 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MYF5P13349 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MYF5P13349 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
MYF5P13349 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
MYF5P13349 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MYF5P13349 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MYF5P13349 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MYF5P13349 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MYF5P13349 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms