Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDH1P12830 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDH1P12830 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDH1P12830 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDH1P12830 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDH1P12830 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDH1P12830 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDH1P12830 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDH1P12830 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDH1P12830 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDH1P12830 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDH1P12830 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDH1P12830 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDH1P12830 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDH1P12830 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CDH1P12830 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDH1P12830 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDH1P12830 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDH1P12830 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CDH1P12830 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDH1P12830 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDH1P12830 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDH1P12830 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDH1P12830 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDH1P12830 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDH1P12830 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDH1P12830 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDH1P12830 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDH1P12830 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDH1P12830 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDH1P12830 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDH1P12830 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDH1P12830 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDH1P12830 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDH1P12830 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDH1P12830 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDH1P12830 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDH1P12830 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDH1P12830 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDH1P12830 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDH1P12830 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDH1P12830 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CDH1P12830 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDH1P12830 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CDH1P12830 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDH1P12830 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDH1P12830 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDH1P12830 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDH1P12830 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDH1P12830 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDH1P12830 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDH1P12830 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CDH1P12830 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDH1P12830 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDH1P12830 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDH1P12830 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDH1P12830 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDH1P12830 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDH1P12830 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDH1P12830 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDH1P12830 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDH1P12830 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDH1P12830 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDH1P12830 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDH1P12830 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDH1P12830 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDH1P12830 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDH1P12830 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDH1P12830 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDH1P12830 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CDH1P12830 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDH1P12830 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CDH1P12830 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDH1P12830 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CDH1P12830 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDH1P12830 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDH1P12830 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDH1P12830 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDH1P12830 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDH1P12830 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CDH1P12830 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
CDH1P12830 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDH1P12830 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDH1P12830 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDH1P12830 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDH1P12830 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDH1P12830 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDH1P12830 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDH1P12830 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDH1P12830 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDH1P12830 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDH1P12830 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDH1P12830 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDH1P12830 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDH1P12830 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDH1P12830 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDH1P12830 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDH1P12830 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDH1P12830 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDH1P12830 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms