Protein–RNA interactions for Protein: P12829

MYL4, Myosin light chain 4, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYL4P12829 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
MYL4P12829 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MYL4P12829 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MYL4P12829 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
MYL4P12829 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MYL4P12829 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MYL4P12829 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MYL4P12829 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MYL4P12829 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MYL4P12829 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MYL4P12829 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MYL4P12829 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MYL4P12829 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MYL4P12829 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MYL4P12829 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MYL4P12829 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
MYL4P12829 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MYL4P12829 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MYL4P12829 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MYL4P12829 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MYL4P12829 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MYL4P12829 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MYL4P12829 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
MYL4P12829 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MYL4P12829 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MYL4P12829 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MYL4P12829 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MYL4P12829 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MYL4P12829 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MYL4P12829 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MYL4P12829 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
MYL4P12829 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MYL4P12829 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MYL4P12829 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MYL4P12829 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
MYL4P12829 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MYL4P12829 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MYL4P12829 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MYL4P12829 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MYL4P12829 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MYL4P12829 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MYL4P12829 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MYL4P12829 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
MYL4P12829 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MYL4P12829 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MYL4P12829 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MYL4P12829 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MYL4P12829 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MYL4P12829 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MYL4P12829 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MYL4P12829 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MYL4P12829 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MYL4P12829 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MYL4P12829 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MYL4P12829 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MYL4P12829 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MYL4P12829 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MYL4P12829 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MYL4P12829 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MYL4P12829 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MYL4P12829 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MYL4P12829 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MYL4P12829 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MYL4P12829 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MYL4P12829 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MYL4P12829 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MYL4P12829 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MYL4P12829 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MYL4P12829 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MYL4P12829 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MYL4P12829 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYL4P12829 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYL4P12829 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYL4P12829 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYL4P12829 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MYL4P12829 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MYL4P12829 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MYL4P12829 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MYL4P12829 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MYL4P12829 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MYL4P12829 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MYL4P12829 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MYL4P12829 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MYL4P12829 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MYL4P12829 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MYL4P12829 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MYL4P12829 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MYL4P12829 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MYL4P12829 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MYL4P12829 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MYL4P12829 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MYL4P12829 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MYL4P12829 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MYL4P12829 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MYL4P12829 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MYL4P12829 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MYL4P12829 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MYL4P12829 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MYL4P12829 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
MYL4P12829 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms