Protein–RNA interactions for Protein: P12755

SKI, Ski oncogene, humanhuman

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIP12755 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SKIP12755 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SKIP12755 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SKIP12755 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SKIP12755 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SKIP12755 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SKIP12755 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
SKIP12755 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SKIP12755 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SKIP12755 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
SKIP12755 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SKIP12755 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SKIP12755 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SKIP12755 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SKIP12755 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SKIP12755 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SKIP12755 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SKIP12755 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SKIP12755 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SKIP12755 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SKIP12755 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SKIP12755 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SKIP12755 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SKIP12755 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SKIP12755 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SKIP12755 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SKIP12755 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SKIP12755 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SKIP12755 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SKIP12755 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SKIP12755 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SKIP12755 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SKIP12755 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SKIP12755 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SKIP12755 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SKIP12755 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SKIP12755 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SKIP12755 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SKIP12755 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SKIP12755 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SKIP12755 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SKIP12755 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SKIP12755 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SKIP12755 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SKIP12755 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SKIP12755 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SKIP12755 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SKIP12755 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SKIP12755 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SKIP12755 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SKIP12755 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
SKIP12755 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SKIP12755 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SKIP12755 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SKIP12755 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SKIP12755 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SKIP12755 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SKIP12755 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SKIP12755 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SKIP12755 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SKIP12755 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SKIP12755 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SKIP12755 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SKIP12755 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SKIP12755 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SKIP12755 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SKIP12755 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SKIP12755 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SKIP12755 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SKIP12755 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SKIP12755 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SKIP12755 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SKIP12755 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SKIP12755 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
SKIP12755 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SKIP12755 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SKIP12755 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SKIP12755 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SKIP12755 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SKIP12755 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SKIP12755 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SKIP12755 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SKIP12755 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SKIP12755 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SKIP12755 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SKIP12755 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SKIP12755 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SKIP12755 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SKIP12755 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SKIP12755 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SKIP12755 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SKIP12755 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SKIP12755 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SKIP12755 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SKIP12755 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SKIP12755 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SKIP12755 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SKIP12755 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SKIP12755 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SKIP12755 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms