Protein–RNA interactions for Protein: P11586

MTHFD1, C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD1P11586 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MTHFD1P11586 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MTHFD1P11586 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MTHFD1P11586 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MTHFD1P11586 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MTHFD1P11586 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MTHFD1P11586 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MTHFD1P11586 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
MTHFD1P11586 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MTHFD1P11586 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MTHFD1P11586 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MTHFD1P11586 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
MTHFD1P11586 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MTHFD1P11586 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MTHFD1P11586 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MTHFD1P11586 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MTHFD1P11586 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
MTHFD1P11586 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MTHFD1P11586 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MTHFD1P11586 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MTHFD1P11586 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MTHFD1P11586 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MTHFD1P11586 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MTHFD1P11586 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MTHFD1P11586 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MTHFD1P11586 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MTHFD1P11586 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MTHFD1P11586 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MTHFD1P11586 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MTHFD1P11586 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MTHFD1P11586 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MTHFD1P11586 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MTHFD1P11586 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MTHFD1P11586 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MTHFD1P11586 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MTHFD1P11586 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MTHFD1P11586 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MTHFD1P11586 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MTHFD1P11586 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MTHFD1P11586 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MTHFD1P11586 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MTHFD1P11586 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
MTHFD1P11586 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MTHFD1P11586 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MTHFD1P11586 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MTHFD1P11586 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MTHFD1P11586 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MTHFD1P11586 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MTHFD1P11586 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MTHFD1P11586 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MTHFD1P11586 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MTHFD1P11586 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MTHFD1P11586 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MTHFD1P11586 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MTHFD1P11586 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
MTHFD1P11586 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MTHFD1P11586 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MTHFD1P11586 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MTHFD1P11586 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MTHFD1P11586 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MTHFD1P11586 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MTHFD1P11586 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MTHFD1P11586 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MTHFD1P11586 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MTHFD1P11586 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MTHFD1P11586 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MTHFD1P11586 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MTHFD1P11586 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MTHFD1P11586 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MTHFD1P11586 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MTHFD1P11586 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MTHFD1P11586 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MTHFD1P11586 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MTHFD1P11586 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MTHFD1P11586 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
MTHFD1P11586 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MTHFD1P11586 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MTHFD1P11586 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MTHFD1P11586 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MTHFD1P11586 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MTHFD1P11586 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MTHFD1P11586 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MTHFD1P11586 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MTHFD1P11586 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MTHFD1P11586 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MTHFD1P11586 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MTHFD1P11586 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
MTHFD1P11586 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MTHFD1P11586 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MTHFD1P11586 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MTHFD1P11586 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MTHFD1P11586 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
MTHFD1P11586 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
MTHFD1P11586 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MTHFD1P11586 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MTHFD1P11586 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MTHFD1P11586 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MTHFD1P11586 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MTHFD1P11586 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
MTHFD1P11586 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms