Protein–RNA interactions for Protein: P0DMC3

APELA, Apelin receptor early endogenous ligand, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APELAP0DMC3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APELAP0DMC3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APELAP0DMC3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APELAP0DMC3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APELAP0DMC3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APELAP0DMC3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APELAP0DMC3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APELAP0DMC3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APELAP0DMC3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APELAP0DMC3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APELAP0DMC3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APELAP0DMC3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APELAP0DMC3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APELAP0DMC3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APELAP0DMC3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APELAP0DMC3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APELAP0DMC3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APELAP0DMC3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APELAP0DMC3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APELAP0DMC3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APELAP0DMC3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APELAP0DMC3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APELAP0DMC3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APELAP0DMC3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APELAP0DMC3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APELAP0DMC3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APELAP0DMC3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APELAP0DMC3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APELAP0DMC3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APELAP0DMC3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APELAP0DMC3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APELAP0DMC3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APELAP0DMC3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
APELAP0DMC3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APELAP0DMC3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APELAP0DMC3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APELAP0DMC3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APELAP0DMC3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
APELAP0DMC3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APELAP0DMC3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APELAP0DMC3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APELAP0DMC3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
APELAP0DMC3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
APELAP0DMC3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
APELAP0DMC3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
APELAP0DMC3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APELAP0DMC3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APELAP0DMC3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APELAP0DMC3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APELAP0DMC3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APELAP0DMC3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
APELAP0DMC3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APELAP0DMC3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APELAP0DMC3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APELAP0DMC3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APELAP0DMC3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APELAP0DMC3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APELAP0DMC3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APELAP0DMC3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APELAP0DMC3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APELAP0DMC3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APELAP0DMC3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APELAP0DMC3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APELAP0DMC3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APELAP0DMC3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
APELAP0DMC3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
APELAP0DMC3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
APELAP0DMC3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APELAP0DMC3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
APELAP0DMC3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APELAP0DMC3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APELAP0DMC3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APELAP0DMC3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APELAP0DMC3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APELAP0DMC3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APELAP0DMC3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APELAP0DMC3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APELAP0DMC3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APELAP0DMC3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
APELAP0DMC3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
APELAP0DMC3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.27■■□□□ 1
APELAP0DMC3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APELAP0DMC3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
APELAP0DMC3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APELAP0DMC3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APELAP0DMC3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APELAP0DMC3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APELAP0DMC3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APELAP0DMC3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APELAP0DMC3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APELAP0DMC3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APELAP0DMC3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APELAP0DMC3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APELAP0DMC3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APELAP0DMC3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APELAP0DMC3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APELAP0DMC3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APELAP0DMC3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APELAP0DMC3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APELAP0DMC3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms