Protein–RNA interactions for Protein: P0C7M7

ACSM4, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM4P0C7M7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACSM4P0C7M7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACSM4P0C7M7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ACSM4P0C7M7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACSM4P0C7M7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACSM4P0C7M7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACSM4P0C7M7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACSM4P0C7M7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACSM4P0C7M7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACSM4P0C7M7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACSM4P0C7M7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACSM4P0C7M7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACSM4P0C7M7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACSM4P0C7M7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ACSM4P0C7M7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACSM4P0C7M7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACSM4P0C7M7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACSM4P0C7M7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACSM4P0C7M7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACSM4P0C7M7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACSM4P0C7M7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACSM4P0C7M7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACSM4P0C7M7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACSM4P0C7M7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACSM4P0C7M7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACSM4P0C7M7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACSM4P0C7M7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACSM4P0C7M7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACSM4P0C7M7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACSM4P0C7M7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACSM4P0C7M7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACSM4P0C7M7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACSM4P0C7M7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACSM4P0C7M7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACSM4P0C7M7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACSM4P0C7M7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACSM4P0C7M7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACSM4P0C7M7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACSM4P0C7M7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACSM4P0C7M7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ACSM4P0C7M7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACSM4P0C7M7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACSM4P0C7M7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACSM4P0C7M7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACSM4P0C7M7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACSM4P0C7M7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACSM4P0C7M7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACSM4P0C7M7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACSM4P0C7M7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACSM4P0C7M7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACSM4P0C7M7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACSM4P0C7M7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACSM4P0C7M7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACSM4P0C7M7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACSM4P0C7M7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACSM4P0C7M7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ACSM4P0C7M7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACSM4P0C7M7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACSM4P0C7M7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACSM4P0C7M7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACSM4P0C7M7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACSM4P0C7M7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACSM4P0C7M7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACSM4P0C7M7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACSM4P0C7M7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACSM4P0C7M7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACSM4P0C7M7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACSM4P0C7M7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ACSM4P0C7M7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACSM4P0C7M7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ACSM4P0C7M7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACSM4P0C7M7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACSM4P0C7M7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACSM4P0C7M7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACSM4P0C7M7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACSM4P0C7M7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACSM4P0C7M7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACSM4P0C7M7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACSM4P0C7M7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACSM4P0C7M7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACSM4P0C7M7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACSM4P0C7M7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACSM4P0C7M7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACSM4P0C7M7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACSM4P0C7M7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ACSM4P0C7M7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ACSM4P0C7M7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACSM4P0C7M7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACSM4P0C7M7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACSM4P0C7M7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACSM4P0C7M7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ACSM4P0C7M7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACSM4P0C7M7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACSM4P0C7M7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACSM4P0C7M7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACSM4P0C7M7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACSM4P0C7M7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACSM4P0C7M7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACSM4P0C7M7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACSM4P0C7M7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms