Protein–RNA interactions for Protein: P0C1Z6

TFPT, TCF3 fusion partner, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFPTP0C1Z6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TFPTP0C1Z6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TFPTP0C1Z6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TFPTP0C1Z6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TFPTP0C1Z6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TFPTP0C1Z6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TFPTP0C1Z6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TFPTP0C1Z6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TFPTP0C1Z6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TFPTP0C1Z6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TFPTP0C1Z6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TFPTP0C1Z6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TFPTP0C1Z6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TFPTP0C1Z6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TFPTP0C1Z6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TFPTP0C1Z6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TFPTP0C1Z6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TFPTP0C1Z6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TFPTP0C1Z6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TFPTP0C1Z6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TFPTP0C1Z6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TFPTP0C1Z6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TFPTP0C1Z6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TFPTP0C1Z6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TFPTP0C1Z6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TFPTP0C1Z6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TFPTP0C1Z6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TFPTP0C1Z6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TFPTP0C1Z6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TFPTP0C1Z6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TFPTP0C1Z6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TFPTP0C1Z6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TFPTP0C1Z6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TFPTP0C1Z6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TFPTP0C1Z6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TFPTP0C1Z6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TFPTP0C1Z6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TFPTP0C1Z6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TFPTP0C1Z6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TFPTP0C1Z6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TFPTP0C1Z6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TFPTP0C1Z6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TFPTP0C1Z6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TFPTP0C1Z6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TFPTP0C1Z6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TFPTP0C1Z6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TFPTP0C1Z6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TFPTP0C1Z6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TFPTP0C1Z6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TFPTP0C1Z6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TFPTP0C1Z6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TFPTP0C1Z6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TFPTP0C1Z6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TFPTP0C1Z6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TFPTP0C1Z6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TFPTP0C1Z6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TFPTP0C1Z6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TFPTP0C1Z6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TFPTP0C1Z6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TFPTP0C1Z6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TFPTP0C1Z6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TFPTP0C1Z6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TFPTP0C1Z6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TFPTP0C1Z6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TFPTP0C1Z6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TFPTP0C1Z6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TFPTP0C1Z6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TFPTP0C1Z6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TFPTP0C1Z6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TFPTP0C1Z6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TFPTP0C1Z6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TFPTP0C1Z6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TFPTP0C1Z6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TFPTP0C1Z6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TFPTP0C1Z6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TFPTP0C1Z6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TFPTP0C1Z6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TFPTP0C1Z6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TFPTP0C1Z6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TFPTP0C1Z6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TFPTP0C1Z6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TFPTP0C1Z6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TFPTP0C1Z6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TFPTP0C1Z6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TFPTP0C1Z6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TFPTP0C1Z6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TFPTP0C1Z6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TFPTP0C1Z6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TFPTP0C1Z6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TFPTP0C1Z6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TFPTP0C1Z6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TFPTP0C1Z6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TFPTP0C1Z6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TFPTP0C1Z6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TFPTP0C1Z6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TFPTP0C1Z6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TFPTP0C1Z6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TFPTP0C1Z6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TFPTP0C1Z6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TFPTP0C1Z6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms