Protein–RNA interactions for Protein: P09326

CD48, CD48 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD48P09326 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CD48P09326 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CD48P09326 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CD48P09326 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CD48P09326 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CD48P09326 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CD48P09326 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CD48P09326 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CD48P09326 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CD48P09326 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CD48P09326 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CD48P09326 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CD48P09326 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CD48P09326 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CD48P09326 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CD48P09326 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CD48P09326 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CD48P09326 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CD48P09326 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CD48P09326 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CD48P09326 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CD48P09326 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CD48P09326 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CD48P09326 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CD48P09326 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CD48P09326 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CD48P09326 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CD48P09326 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CD48P09326 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CD48P09326 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CD48P09326 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CD48P09326 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CD48P09326 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CD48P09326 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CD48P09326 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CD48P09326 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CD48P09326 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CD48P09326 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CD48P09326 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CD48P09326 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CD48P09326 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CD48P09326 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CD48P09326 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CD48P09326 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CD48P09326 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CD48P09326 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CD48P09326 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CD48P09326 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CD48P09326 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CD48P09326 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CD48P09326 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CD48P09326 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CD48P09326 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CD48P09326 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CD48P09326 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CD48P09326 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CD48P09326 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CD48P09326 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CD48P09326 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CD48P09326 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CD48P09326 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CD48P09326 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CD48P09326 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CD48P09326 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CD48P09326 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CD48P09326 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CD48P09326 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CD48P09326 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CD48P09326 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CD48P09326 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CD48P09326 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CD48P09326 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CD48P09326 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CD48P09326 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CD48P09326 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CD48P09326 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CD48P09326 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CD48P09326 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CD48P09326 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CD48P09326 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CD48P09326 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CD48P09326 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CD48P09326 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CD48P09326 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CD48P09326 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CD48P09326 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CD48P09326 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CD48P09326 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CD48P09326 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CD48P09326 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CD48P09326 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CD48P09326 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CD48P09326 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CD48P09326 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CD48P09326 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CD48P09326 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CD48P09326 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CD48P09326 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CD48P09326 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CD48P09326 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms