Protein–RNA interactions for Protein: P08559

PDHA1, Pyruvate dehydrogenase E1 component subunit alpha, somatic form, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDHA1P08559 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDHA1P08559 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PDHA1P08559 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDHA1P08559 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PDHA1P08559 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDHA1P08559 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDHA1P08559 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDHA1P08559 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDHA1P08559 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDHA1P08559 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDHA1P08559 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDHA1P08559 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDHA1P08559 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PDHA1P08559 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDHA1P08559 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PDHA1P08559 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PDHA1P08559 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PDHA1P08559 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PDHA1P08559 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PDHA1P08559 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PDHA1P08559 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PDHA1P08559 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PDHA1P08559 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PDHA1P08559 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PDHA1P08559 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDHA1P08559 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDHA1P08559 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDHA1P08559 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDHA1P08559 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDHA1P08559 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDHA1P08559 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDHA1P08559 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDHA1P08559 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDHA1P08559 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDHA1P08559 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDHA1P08559 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDHA1P08559 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PDHA1P08559 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDHA1P08559 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDHA1P08559 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDHA1P08559 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDHA1P08559 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDHA1P08559 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDHA1P08559 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDHA1P08559 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDHA1P08559 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDHA1P08559 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PDHA1P08559 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PDHA1P08559 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDHA1P08559 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDHA1P08559 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDHA1P08559 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PDHA1P08559 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDHA1P08559 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDHA1P08559 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDHA1P08559 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDHA1P08559 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDHA1P08559 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDHA1P08559 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PDHA1P08559 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDHA1P08559 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDHA1P08559 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDHA1P08559 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDHA1P08559 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDHA1P08559 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDHA1P08559 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDHA1P08559 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PDHA1P08559 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDHA1P08559 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDHA1P08559 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDHA1P08559 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDHA1P08559 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDHA1P08559 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDHA1P08559 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDHA1P08559 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDHA1P08559 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDHA1P08559 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDHA1P08559 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDHA1P08559 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDHA1P08559 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDHA1P08559 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDHA1P08559 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDHA1P08559 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDHA1P08559 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDHA1P08559 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDHA1P08559 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDHA1P08559 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDHA1P08559 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDHA1P08559 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDHA1P08559 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDHA1P08559 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDHA1P08559 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDHA1P08559 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDHA1P08559 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDHA1P08559 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDHA1P08559 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDHA1P08559 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDHA1P08559 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDHA1P08559 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDHA1P08559 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1289 ms